文明十一年（1479年），在京都御所的位置上营造了最初的皇居，当时的规模很小，北侧室现在的常御所，南侧是日华门及月华门，东侧是小御所和学问所的背面，西侧是土屏西的砂场等。到了天正十七年（1589年），扩建了皇居的东部和北部，完成了常御所、小御所、紫场宸殿、御汤殿等。庆长十一年又增建了御所和仙洞，同时也完成了黑户御所得庭园。随后在承应二年（1653年）、万治四年（1661年）、宽文十三年（1673年）等等年代曾经过多次的火灾，而且每次火灾后都进行了不同程度地重建。

现在的京都御所四面环水，南侧有建礼门、东侧有建春门、西侧是宜秋门，北侧是朔平门。另外，在宜秋门的北侧有清所门，建礼门的内侧是承明门及回廊，东侧室日华门，西侧是月华门。小御所的庭园是被称为御池之庭的回游氏庭园，总面积8，200平方米，池庭部分为2，400平方米。另外，从常御所到听雪之间的庭被称为御庭，总面积7，000平方米，溪流的部分为300平方米。

小御所最初位于紫宸殿的东北，并向东而建，后由宽永的远州改建面向南，同时设置了远州自己的最得意的矩形池庭。后来在承应营造石又恢复了原来向东的位置，后又通过宽文的营造，形成了现在看到的北侧与御学问所相接的小御所。小御所前庭是用白砂铺设的园路，并且沿着池庭形成了一个半圆形的草坪。从池庭的北端到东南有三和连续的中岛，推测是镰仓末期修建的，寓意蓬菜、方丈、瀛洲三仙岛。其中最大的南岛为蓬菜岛，上有东西两桥，西侧是榉桥。

池庭的北岸有从常御所流出的小溪流，常御所又被称为御内庭，因为在延宝以前是黑户御所的旧址，所以庭园也被称作为黑户御所的庭园进行营造。常御所前有溪流通过，如果登上东部的山丘就可以看到锦台和御文库，其间有各种各样丰富的石组，植栽也十分繁茂，这也是宽政以后地处理手法。沿溪流北上，常御所北部有一处板桥，过桥后可以看到泉殿，其周围是缓缓流动的溪流，多处设置的平石池岸，是以宽政营造和安政营造为中心的设计手法。另外，听雪前的溪流分为东西两个方向，西侧的溪流形成了御凉所前的小池，在那里还设置了中岛。中岛的南部和东西三处设置了自然石的石桥，加上石组池岸和修剪的植栽，体现了江户末期的造园表现手法。(www.daowen.com)

京都御所中使用的庭石种类十分繁多，而且多为京都附近的花岗岩系山石，例如：贵船石、鞍马石、加茂川石、绿泥片岩等。在小御所和常御所以外部分的屋或者室等建筑物前种植了藤、荻、葵等植物，可以看到《源氏物语》等书中的描写记述。京都御所中无论是建筑还是庭园都经常有人在精心管理，优美的庭园加上清洁整齐的环境，生长极为繁茂的植栽，使每一位来访者流连忘返。

上图：京都御所庭园全景
中图：京都御所庭园小御所御池庭全景
下图（由左至右）：京都御所庭园小御所御池庭石岸和榉桥；京都御所庭园小御池庭一景；
京都御所庭园内庭听雪东的溪流和石桥；京都御所庭园内庭常御所前溪流