系统设计作为信息系统开发过程中的重要一环，所使用的方法还是：先以自顶向下结构化的设计方法完成系统的总体设计，包括子系统的划分、网络设计和配置、设备选型、运行环境的设计和数据库管理系统的选择等；然后是详细设计，包括代码设计、数据库设计、输入输出设计、人机界面设计等。这一阶段的成果是系统设计报告，是下一阶段系统实施的主要依据。

系统设计主要依据系统分析阶段生成的系统分析报告和开发者的知识与经验，系统设计时应尽量遵守以下原则：

（1）简单性。在达到预定目标、具备所需要功能的前提下，系统应尽量简单，这样可减少处理费用，提高系统效益，便于实现和管理。

（2）系统性。系统是作为统一整体而存在的，因此，在系统设计中，要从整个系统的角度进行考虑，系统的代码要统一，设计规范要标准，传递语言要尽可能一致，对系统的数据采集要做到数出一处、全局共享，使一次输入得到多次利用。(www.daowen.com)

（3）灵活性。为保持系统的长久生命力，要求系统具有很强的环境适应性，一个可变性好的系统，各个部分独立性强，容易进行变动，从而可提高系统的性能，不断满足对系统目标的变化要求，为此，系统应尽量采用模块化结构，提高各模块的独立性，尽可能减少模块间的数据耦合，使各子系统间的数据依赖减至最低限度。这样，既便于模块的修改，又便于增加新的内容，提高系统适应环境变化的能力。

（4）可靠性。可靠性是指系统抵御外界干扰的能力及受外界干扰时的恢复能力。一个成功的管理信息系统必须具有较高的可靠性，如安全保密性、检错及纠错能力、抗病毒能力等。

（5）经济性。经济性是指在满足系统需求的前提下，尽可能减小系统的开销。一方面，在硬件投资上不能盲目追求技术上的先进，而应以满足应用需要为前提；另一方面，系统设计中应尽量避免不必要的复杂化，各模块应尽量简洁，以便缩短处理流程、减少处理费用。