第三方支付中所形成的法律关系主要有三种：交易双方之间、第三方支付平台与用户之间、第三方支付平台与银行之间的法律关系。其中，后两种是最为关键的两种法律关系。

第三方支付平台与用户之间的法律关系。交易中，买方、卖方都需要在平台注册，成为该平台的用户，在买方、卖方与平台之间达成服务合同。用户注册时，有义务保证资料真实性，否则平台有权拒绝提供服务；用户也有权要求平台妥善保管个人信息资料。买方下单并付款后，资金从买方银行账户转至平台账户，买方收到货物并验收合格后，向平台发出确认收货指令，平台就会将相应价款转移至卖方银行账户。在发货与收货的时间差期间，货款暂存于平台账户，形成沉淀资金。平台对沉淀资金应基于委托合同进行管理。此外，用户可以提前将资金充值到自己在平台的账户，该资金暂时由平台保管；未得到用户指令，平台不得将资金挪作他用。此时，用户与平台之间是资金保管法律关系。(www.daowen.com)

第三方支付平台与银行之间的法律关系。第一种法律关系存在于平台与用户的开户行之间，另一种存在于平台与备付行之间。在此，以支付宝为例加以说明。在第一种法律关系中，买方的开户行为付款行，买方开户银行在接到买方付款指令后划拨货款；卖方的开户行为收款行。平台在开展业务前与各银行签订金融服务协议，由各银行向平台提供网关接口，平台将不同银行的网关接口整合在统一界面，平台与用户开户行之间的法律关系属于支付服务合同关系。在第二种法律关系中出现了备付行，即与平台签订备付存管协议的银行，承担为客户备付金提供存管服务的义务。交易中平台收到的买方付款的资金应存管在平台开通的备付行中，备付行有义务对客户备付金账户进行妥善管理，保障资金安全。平台与备付行之间属于资金存管法律关系。