关于外来物种入侵所威胁生态系统和生境的保护，国际社会也通过了大量文件加以规范，但此类文件多以软法、准则和指南为主。

对农业生物多样性，《国际植物保护公约》项下已经制定了大量的关于农业系统风险的指南和标准。而前述《卡塔赫纳生物安全议定书》的规范对象，则是可能对生物多样性造成不利影响的改性活生物体的跨界运动。

对于缺水和半湿润地区的生物多样性，《公约》与《联合国防治荒漠化公约》（以下简称《荒漠化公约》）联合工作方案列举的优先行动中，包括了对外来侵入物种的管理。但《荒漠化公约》迄今并未作出任何明确针对外来侵入物种的规定，其工作方案建议应该制定相关指南，在通过植树造林、种植防风林和防护林带解决土地退化问题和利用物种控制水土流失及增强地力等方案中，防止引进潜在的外来侵入物种。

湿地特别容易受到生物入侵，因为水的存在吸引了能很快与当地物种竞争的入侵者。虽然1971年《关于特别是水禽栖息地的国际重要湿地公约》的缔约国会议2002年通过了《关于入侵物种和湿地的第Ⅷ/18号决议》，敦促缔约国缔约方利用各机构和其他公约项下制定的工具和指南，以果断和纵观全局的方式处理与外来侵入物种有关的湿地问题，特别是：解决湿地入侵物种环境、经济与社会影响；准备外来物种的清单和评估；制定控制与消除计划；通过立法防止向它们境内引进新的或威胁环境的外来物种，并在其管辖内管理它们的活动或贸易。(www.daowen.com)

在海洋和沿海生态系统的生物多样性方面，1982年《联合国海洋法公约》要求缔约国采取一切必要措施以防止、减少或控制由于故意或偶然在海洋环境某一特定部分引进外来的或新的物种致使海洋环境可能发生重大和有害的变化。

防止内陆水体受到外来物种入侵是1997年《国际水道非航行利用法公约》的主题。该公约第22条要求水道国采取一切必要手段防止向国际水道引进外来的或新的物种，如果这种引进可能对水道生态系统造成有害影响并因而严重损害其他水道国。

相对而言，外来侵入物种问题在国际森林政策进程中极少得到注意。联合国政府间森林问题小组/政府间森林问题论坛提出的行动建议，虽然主张使用原生物种，尤其是在森林覆盖少的国家，但并没有明确对外来侵入物种进行规范。在《公约》森林生物多样性扩大工作方案中，包含了两项具体针对在森林生态系统中防止引进外来侵入物种和减少其影响的活动。已知若干在种植林、小片林和农林混合林中生长的物种具有侵入性。粮农组织已经开始编制有关森林侵入物种的资料。在2004年5月第20次亚太森林委员会会议上（Asia-Pacific Forestry Commission，APFC）正式启动了亚太森林物种入侵网络（Asia-Pacific Forest Invasive Species Network，APFISN），旨在解决预防、监测、消除和控制森林入侵物种方面的技术和组织问题。