1988年，全自治区有8个地区（南宁地区、柳州地区、桂林地区、梧州地区、玉林地区、钦州地区、百色地区、河池地区），5个自治区辖市（南宁市、柳州市、桂林市、梧州市、北海市），83个县、市（其中12个自治县，7个县级市），17个市辖区，5个市郊区，22个街道，1011个乡，63个民族乡，291个镇。

20世纪90年代后，行政区划工作始终坚持为广西改革开放和经济建设服务，为自治区“三大战略、六大突破”的发展战略服务，在保持稳定的前提下，对地市、县（市、区）、乡镇行政区划进行必要的调整。通过合理地调整行政区划，较好地促进全自治区经济社会发展和推动城镇化进程。

1990年2月10日，广西壮族自治区人民政府依据国务院《地名管理条例》制定并公布《广西壮族自治区地名管理规定》，广西行政区划工作进入法制时代。1991年，各级地名委员会办公室由非常设机构列入政府行政系列，成为各级政府的职能部门。1993年2月成立广西壮族自治区地名档案馆，负责全区地名档案资料的收集、整理、鉴定、归档、更新和编研利用，指导全区地名档案工作。

1993年3月，自治区民政厅成立行政区划处，行政区划工作有了专门机构。1990—1995年，广西的行政区划工作的主要任务，一是制订设市规划，二是调整沿海和桂东南的地区体制。

1996年3月1日，国务院勘界工作领导小组印发《勘定省级行政区域界线总体方案》；6月26日，国务院总理办公会议研究广西行政区划调整问题，同意广西提出的地市调整方案，先行在梧州地市试点。1997年2月，国务院同意调整梧州地区和梧州市行政区划，撤销梧州地区，新设贺州地区。

1996—2003年，广西的行政区划工作在勘界、地市调整、乡改镇、撤并乡镇、地名标准化等方面全面展开，新的行政区划格局基本形成，依法治理行政区域界线、依法管理政区地名的基础基本具备。(www.daowen.com)

2003年8月，崇左市挂牌成立，广西完成地市合并，结束了地市同驻一地的历史，实现市管县的体制。至2003年底，全自治区建制市增加到21个，其中地级市14个。

2002—2005年，完成地名补查和更新工作准备和资料收集工作，共收集整理《地名总目》109卷（册）。

2005年，全自治区行政区划为14个地级市，7个县级市，56个县，12个民族自治县，34个市辖区，700个镇，426个乡（含58个民族乡），104个街道。

1990—2005年，广西行政区划与地名的有关情况已在2016年9月出版的《广西通志·行政区划志（1990—2005）》中记述，本篇不再详记。