20世纪90年代中开始，洪涝灾害成为广西发生频率最高、影响最大的自然灾害。1994—2005年，广西先后发生5次特大洪涝灾害。洪涝灾害的成因与暴雨、台风紧密相关，主要是短时间内密集的强降雨所致。强降雨一般从4月份开始，集中发生的时段为5月下旬至8月。

1988年继5月、6月、7月发生严重旱灾之后，8月下旬，由于受副热带高压和南下冷空气影响，广西北部连降暴雨到特大暴雨，暴雨中心累计日降雨量高达611毫米，造成山洪暴发，江水急剧暴涨，黔江与柳江两股洪水一起汇合，致使西江上游的红水河，柳江发生特大洪水。9月1日，柳江洪峰到达柳州时，水位涨到89.04米以上，流量达2.66万立方米/秒，超过警戒水位9.04米，是1931年有记录以来出现的最大洪水，柳州市有20%的单位和地段被淹。从柳江到桂平至梧州沿岸100多千米一片汪洋，柳州、玉林、梧州等地、市部分乡（镇）被洪水淹没，黔桂、枝柳铁路遭受洪水袭击，交通、邮电通信、供电线路等都中断。至9月6日，受灾较严重的有柳江沿岸的柳城、柳江、武宣、桂平，红水河沿岸的天峨、东兰、来宾、都安以及西江沿岸的平南、藤县、苍梧、梧州等市、县。全自治区有40个县（市）受淹，452个乡镇2424个村公所严重受灾，十分之一的人口受灾，洪水袭击主要粮食和经济作物产区，受淹农作物20多万公顷，灾害造成直接经济损失9.49亿元。

1994年5月—7月，强热带风暴、特大洪灾连续3次袭击广西：第一次灾害从5月下旬开始到6月上旬，特别是6月8日第3号热带风暴正面袭击玉林、梧州、北海等地，受其影响，6月10日—20日，桂北、桂西、桂中有67个县（市）连降大暴雨和特大暴雨，引起山洪暴发，河水泛滥，河防、河堤、库坝大量崩溃、决口。境内的红水河、桂江、漓江、西江等江河流域水位暴涨，6月17日13时，柳州市水位高达89.25米，超过警戒水位7.75米；6月19日8时，梧州市西江水位高达25.91米，超过警戒水位10.91米，是1915—1994年期间最大的一次洪水。灾害造成直接经济损失180亿元。第二次灾害是当年第4号热带风暴于6月25日—27日袭击广西，紧接着第5号强台风于7月4日下午进入玉林地区南部，狂风、特大暴雨横扫玉林、柳州、河池等50多个县（市），酿成特大洪灾和内涝。第三次灾害发生在7月10日—28日，广西先后受高空切变线、低涡、弱冷空气以及西南季风等天气影响，后又遭受北部湾热带低压袭击，全自治区持续出现大暴雨的强降雨过程，梧州、玉林、河池、钦州等63个县（市）再次遭受大面积洪涝灾害。贵港市境内的郁江水位7月21日达48.36米，超过警戒水位5.36米，全市有69条河流漫顶，10条缺堤。梧州市7月24日23时洪峰水位为24.45米，超过警戒水位9.45米。降雨过程总降雨量在300毫米以上有8个县（市），200～299毫米的14个县（市），100～199毫米的41个县（市）。这次暴雨中心与洪水流向一致，致使沿江洪水来势猛，涨幅大。广西境内的柳江、红水河、邕江、郁江和桂江等主要河流两岸一片汪洋。三次灾害导致全自治区88个县（市）中的85个县（市）受灾，其中重复受灾的县（市）有60多个，受灾人口2128万人次，其中392万人被洪水围困，130多万人被转移安置；因灾死亡872人，伤病26917人；房屋倒塌71.7万间；农作物受淹面积165.1万公顷，成灾面积114.1万公顷，其中失收54万公顷，减产粮食176.5万吨。全年台风、洪涝灾害造成的直接经济损失367.6亿元，其中3号台风灾害的损失4.99亿元，6月中旬洪灾损失180亿元，7月下旬洪灾损失182.6亿元。重灾区有梧州、平南、桂平、贵港、贺县、博白、藤县、苍梧、钟山县等24个市、县。

1996年6月23日—7月4日，广西遭遇持续大范围的强降雨过程，至7月2日，受灾较重的有27个县（市），受灾人口300多万，受灾农作物17.266万公顷；因灾倒塌民房11282间，严重损坏15000间，因灾死亡29人。至7月4日，新增桂林、梧州、贵港、河池、百色、钦州等6个地（市）的20个县（市）220个乡镇受灾，受灾人口244.7万，成灾人口142.5万，因灾死亡8人，农作物受灾18.58万公顷，其中成灾8.153万公顷，绝收2.087万公顷；倒塌民房4866间，严重损坏15784间；死亡大牲畜981头，因灾造成直接经济损失6.43亿元。同年7月15日—19日，桂中地区大范围连降大暴雨，降雨量在300毫米以上的有8个县，其中三江侗族自治县降雨量达469毫米；100～200毫米的有20多个县（市），降雨过程主要集中在桂林、柳州、河池、百色、南宁等地，柳江、古宜河、贝江、融江、漓江、龙江、黔江、浔江等大小江河发生历史罕见的大洪水和特大洪水。柳州市区90%以上的地域进水，196条街道受淹，21.3万人转移，92.43米水位线以下的供电、供水、供气设备受淹，造成停电、停水、停气，交通瘫痪，93.2%的工矿企业受灾，湘桂、黔桂、枝柳3条铁路被迫中断，大批旅客滞留。此次降雨过程造成全自治区39个县市870万人受灾，倒塌房屋105万间，严重损坏121万间；因灾死亡252人，伤病6.6万人；农作物受灾面积47.333万公顷，其中成灾面积32.333万公顷，绝收10.267万公顷；因灾死亡大牲畜24.5万头；受淹或被围困的县城21个，一度被洪水围困的群众165.5万人，紧急转移、抢救、安置灾民110万人，因洪水被迫停工停业的工矿企业6025家，损坏大中型水库2座，小型水库61座，堤坝12487处；中断公路交通188条196处，冲毁路基1549千米，塌方8358处，毁坏桥梁31座，涵洞932处，通信、电力等基础设施损失惨重，因灾造成直接经济损失158.9亿元。(www.daowen.com)

1996年，柳州市遭遇有史料记载以来的特大洪水袭击。图为1996年7月19日，柳州市市区遭遇洪水袭击的景象

1998年6月—7月，广西连降暴雨和特大暴雨，黔江、漓江、桂江、柳江河水暴涨，致使下游的西江、浔江水位猛涨，沿江市县出现大洪水或特大洪水。桂林、梧州受灾严重。特大洪涝灾害造成全自治区62个县（市、区）受灾，农作物受灾面积143.38万公顷，成灾面积94.6万公顷，其中绝收面积31.273万公顷，因灾损失粮食20.8亿公斤；受灾人口2591.1万，成灾人口1721万，其中特重灾民达413万人，因灾死亡345人，伤病10.7万人；民房倒塌28.6万间，严重损坏137.8万间；因灾造成直接经济损失177亿元。

2005年6月18日—22日，广西出现持续性暴雨天气过程，桂江、桂北、桂中、桂东等地69个县（市、区）造成流域性洪水和山洪暴发，西江、浔江、黔江等大江大河水位暴涨，全面超过警戒水位，桂平、平南、藤县、昭平、梧州市长洲等县（市、区）沿江两岸大片农作物受淹，大批房屋倒塌；象州、平南、桂平、昭平、金秀、忻城等许多县（自治县、市）山洪暴发，并瞬间冲倒房屋，淹没农作物，其中连片倒塌10间以上房屋的村屯就达到300多个，有27个县在短时间内重复受灾。灾害造成全自治区2409.6万人受灾，紧急转移安置灾民94.5万人，因灾死亡135人；倒塌房屋26.2万间，其中连片倒塌房屋10户以上的有324个自然村；损坏房屋67万间；农作物受灾面积141.1万公顷，其中，绝收30.9万公顷；因灾直接经济损失130.5亿元，其中农作物损失62.4亿元。