明以前皇帝亲祭有否祝文，史书无载。按理应该读祝，但文献中未见。清代皇帝亲祀仪注中确有读祝程序，但文献中无载，其原因应该是皇帝亲祀多选在春秋上丁，所用应该是标准祝文，没必要著录，但丁祭外的亲祀应该新撰，奇怪的是文献全无记载。现在能够见到的只有明世宗改变文庙祀典亲自释奠时御制的祝文，此祝文还用于遣官致祭南京国子监文庙与曲阜孔子庙。

明嘉靖九年（1530年），明世宗厘正文庙祀典，改孔子称号大成至圣文宣王为至圣先师，文庙为先师庙，大祀为中祀，等等；次年亲自告祭北京国子监文庙，服皮弁谒庙，用特牲，奠帛，行释奠礼，迎神、送神各再拜，三乐三奏，文舞六佾，配享从祀及启圣祠分奠用酒脯，遣官致祭于南监及阙里，并亲自撰写祝文。

维嘉靖十年，岁次辛卯，月日，皇帝致祭于先师孔子曰：“自昔混沌之初，天命羲农轩圣创世开物，以至尧舜禹汤文武周公及先师列圣相继，奉天行道，立教诲人。肆我圣祖再造区宇，化行天下。我圣祖崇礼于先师者，御制有文，典册具在。予惟寡昧之人，近仰遵祖宪，去亵慢之偶像如祖制，崇礼之圣谟号称核实，俎豆究本以遵祖典，兼体先师至意。予实不聪，赖先师默鉴及良辅洪儒所赞之也。爰择令辰，奉安先师神位以及附飨之位于此，惟先师鉴知，永依陟降，大运神化，教我君民。俾予性理早开而无负皇天付托之眷命，暨士庶学业咸正而无违先师传道之至情，予实有望焉，先师鉴之。以复圣颜子、宗圣曾子、述圣子思子、亚圣孟子配。尚飨！”^[127]

明明降低了祭祀孔子的等级，却说是“兼体先师至意”。

清雍正七年（1729年），曲阜孔子庙重建大成殿，上梁前二日，庆云出现于曲阜，大学士等以阙里大成殿上梁庆云呈现，奏请宣付史馆。雍正皇帝谕内阁说：“朕平素尊崇先师，至诚至敬。雍正二年，阙里文庙不戒于火，比时廷臣援明代弘治前事为言，而朕心悚惧不宁，引过自责，亲诣太学文庙虔诚告祭，特发帑金，命大臣等督工修建，凡殿尻制度规模以至祭器仪物皆令绘图呈览，朕亲为指授，遴选良工，庀材兴造，虔恪之心数年以来无时梢间。今大成殿上梁前二日庆云现于曲阜，卿等归美朕躬之词，朕不克当，或者上帝、先师鉴朕悚惕诚敬之心，现兹云物昭示瑞应。朕不敢矜言祥瑞，但能功过相抵，朕之幸也。应择日躬诣太学文庙告祭，以申感庆之衷，一切礼仪着该部速议具奏。朕躬被先师之福佑，普天士子诵法服膺，同受圣人之泽，着将明年会试取中额数广至四百名，壬子科各省乡试每正额十名加中一名，其十名之外有零数者亦加中一名。此朕体奉先师乐育之盛心，特行造就人才之旷典，诸士子其各兴文敦行，益加勉旃。”十月辛酉，雍正皇帝亲诣国子监，告祭孔子，御制了此次祭祀的祭文。

金声玉振，集神圣之大成；霞蔚云蒸，表天人之上瑞。肃将藻，奉告几筵。仰惟先师孔子德迈皇王，学该河洛，综五百年之传绪，聿竣宫墙，立亿万代之师模，永光俎豆。自庙堂之重建，准宫殿之鸿规，尽诚敬以经营，务尊崇其制度。乃者将升画栋，选卜良辰，忽睹卿云，光辉晴昼，芝英烂漫，映泗水以霏烟，车盖轮囷，倚尼冈而结影。当前期之二日，有开必先，瞻垂象者三时，惟形则著。绚于东国，显征丹雘之祥；耀彼南方，弘阐文明之运。上帝之凝庥滋至，先师之降鉴孔昭。实感庆于衷怀，用吉蠲而躬诣。於戏！羹墙如见，弥殷重道之忱；霄汉为章，佑启作人之化。神其如在，歆享苾芬。

曲阜孔子庙遭雷火被焚，压在皇帝心头五年的悚惧终于随着庆云的出现而消失，皇帝借祭文也淋漓酣畅地发泄了一番。

《钦定大清通礼》载皇帝亲祭祝文为；(www.daowen.com)

维某年月日，皇帝御名致祭于至圣先师孔子，曰：“惟师德配天地，道冠古今，删述六经，垂宪万年。兹当仲春秋，祗奉旧章，谨以牲帛酒果致祭，配以复圣颜子、宗圣曾子、述圣子思子、亚圣孟子。尚飨！”^[128]

清代祝版有规定，祭祀孔子祝版与太庙、社稷坛等均为“白纸黄缘墨书”。

金声玉振，集神圣之大成；霞蔚云蒸，表天人之上瑞。肃将藻，奉告几筵。仰惟先师孔子德迈皇王，学该河洛，综五百年之传绪，聿竣宫墙，立亿万代之师模，永光俎豆。自庙堂之重建，准宫殿之鸿规，尽诚敬以经营，务尊崇其制度。乃者将升画栋，选卜良辰，忽睹卿云，光辉晴昼，芝英烂漫，映泗水以霏烟，车盖轮囷，倚尼冈而结影。当前期之二日，有开必先，瞻垂象者三时，惟形则著。绚于东国，显征丹雘之祥；耀彼南方，弘阐文明之运。上帝之凝庥滋至，先师之降鉴孔昭。实感庆于衷怀，用吉蠲而躬诣。於戏！羹墙如见，弥殷重道之忱；霄汉为章，佑启作人之化。神其如在，歆享苾芬。

曲阜孔子庙遭雷火被焚，压在皇帝心头五年的悚惧终于随着庆云的出现而消失，皇帝借祭文也淋漓酣畅地发泄了一番。

《钦定大清通礼》载皇帝亲祭祝文为；

维某年月日，皇帝御名致祭于至圣先师孔子，曰：“惟师德配天地，道冠古今，删述六经，垂宪万年。兹当仲春秋，祗奉旧章，谨以牲帛酒果致祭，配以复圣颜子、宗圣曾子、述圣子思子、亚圣孟子。尚飨！”^[128]

清代祝版有规定，祭祀孔子祝版与太庙、社稷坛等均为“白纸黄缘墨书”。