《除弊章程碑》刊立于光绪二十四年（1898）春，《恩垂万世碑》刊立于光绪三十一年（1905）四月。此二碑的刊刻，既有相同的社会背景，也有各自的原因，下面结合相关资料分别做简要分析。

相同的背景。一、社会大背景。自雍正年间开始实行的“改土归流”，到了光绪年间，中南、西南的大部分地区的土司制度被废除，从而减少了叛乱的因素，加强了中央政府对于边疆的统治。西北地区的土司，一般为武职，势力较小，并且在清代前期、中期经常配合朝廷出征作战，因此雍正以后的历次“改土归流”对西北的土司影响都不大。但是到了清代末期，由于战乱、天灾、土司的苛派等多种原因，土司所管辖的境内时常发生反抗，很大程度上影响到了边疆的稳定，因此中央政府采取各种手段约束、限制土司的权利，以加强政府对土司的管控。二、区域小背景。同治年间的回民大起义，对舟曲的影响很大，境内的藏族人民也纷纷起义，打击清军，虽然起义最终都在清军和土司的联合围攻下失败，但很大程度上动摇了中央政府对土司的信任。特别是发生在光绪六年（1880）的舟曲瓜子沟的藏族群众反清斗争，震惊朝野，光绪皇帝亲自谕令左宗棠查办，可见此事影响之深远。在镇压瓜子沟反清斗争的过程中，尽管卓尼的杨土司和宕昌的马土司都积极参与，但是二人却镇压不力，朝廷不得不从其他地方调兵遣将，最后起义虽然被镇压，但是朝廷和官军对马土司和杨土司的不满也逐渐积聚，意图“改土归流”削弱他们的势力，通过逐渐蚕食周边土地的办法，压缩其势力范围。^[3]这是此二碑刊刻相同的背景。

《除弊章程碑》的刊刻背景还包括碑文中所提到的“光绪二十二年黑番四旗仇杀报复一案”。根据碑文内容推断，当是黑番四旗的藏民与长限之间的冲突，具体来说指黑番四旗的百姓不满长限剥削而抗粮的运动。黑番四旗，康熙年间成为卓尼杨土司的辖地，包括阳山旗、铁坝旗、阴山旗、代巴旗，均在今舟曲境内，因其服装多系黑色故称“黑番”。长限又称旗长，是土司的属下，负责钱粮征收、诉讼及出征等事务。黑番四旗有长限一人，职权较大，又因距离卓尼县城较远，可以单独处理案件，土民打官司所交的衙门钱等，归自己所有。^[4]同样是因为距离卓尼较远，此地的长限便私占横征、肆意苛索，由此导致了藏族群众的不满，从而招致仇杀报复一事的发生。因此陕甘总督饬阶州朱知州秉公审断，故拟定除弊章程，刊刻于石，让土司、长限、总管及藏族百姓等永远遵守。(www.daowen.com)

而《恩垂万世碑》的刊刻背景还有“壮喇嘛王代臣，假借故土司马承烈名号，巧立款目，苛派百姓，以致汉番聚众滋事”，即有人假借土司名号，苛索土民。为何会出现这种情况呢，看一下碑刻的刊立时间是光绪三十一年，这一年，第十八代土司马承烈刚刚去世，而其子马培德尚小，于是岷州州府便行文由马承烈的堂侄马继贤任土司。^[5]因此“假借土司名号一事”当发生在马承烈死后不久到马继贤继任土司之间这段时间内，因消息闭塞及新土司未上任的原因，给了投机分子可乘之机。不过纸里包不住火，汉藏群众知道事情真相后，便引发了一场抗缴粮食的运动，影响到了土司及地方政府的统治。岷州会同各方查实后，禀报上级，拟定条款，约束与调整土司制度，刊刻石碑，以安抚民心。

总之，旧的土司制度到了清末，已经显现出不少弊端，一定程度上影响到了土司乃至地方政府的统治，适时地对土司制度进行约束与调整迫在眉睫，这一举措，对稳定边疆统治起到了积极的作用。