基金预算收入也称政府性基金预算收入，是指各级政府财政按规定收取、转入当年财政安排，由财政管理并具有指定用途的政府财政预算资金收入。例如，按照《民航机场管理建设费征收使用管理办法》的规定征收的民航机场管理收入，应当用于民航机场管理建设方面的支出；地方财政按照《残疾人就业保障金管理暂行规定》征收的残疾人就业保障金收入，应当用于残疾人就业保障方面的等。建立政府性基金预算制度，对于筹集政府需要开展的有关专门业务活动能够顺利进行，减轻政府一般预算的压力，具有重要的现实意义。

财政总预算会计基金核算的预算收入分类与《政府收支分类科目》中的基金预算科目相一致。按照现行《政府收支分类科目》，“基金预算收入”科目分为“非税收入”“转移性收入”两个类级科目。其中，“非税收入”科目下设“政府性基金收入”“转移性收入”“政府性基金转移收入”三个款级科目。类、款、项、目四级科目逐级递进，内容也逐级细化。

“政府性基金收入”款级科目下设置的项级科目有：三峡工程建设基金收入，农网还贷资金收入，山西省煤炭可持续发展基金收入，山西省电源基地建设基金收入，铁路建设基金收入，福建省铁路建设附加费收入，民航基础设施建设基金收入，民航机场管理建设费收入，海南省高等级公路车辆通行附加费收入，转让政府还贷道路收费，港口建设费收入，散装水泥专项资金收入，新型墙体材料专项基金收入，中央对外贸易发展基金收入，旅游发展基金收入，援外合资合作项目基金收入，国家茧丝绸发展风险基金收入，文化事业建设费收入，地方教育附加收入，国家电影事业发展专项资金收入，新菜地开发建设基金收入，新增建设用地土地有偿使用费收入，森林植被恢复费，中央水利建设基金收入，地方水利建设基金收入，南水北调工程基金收入，残疾人就业保障金收入，政府住房基金收入，城市公用事业附加收入，国有土地使用权出让金收入，国有土地收益基金收入，农业土地开发资金收入，大中型水库移民后期扶持基金收入，大中型水库库区基金收入，三峡永库库区基金收入，中央财政外汇经营基金收入，中央财政外汇经营基金财务收入，彩票公益金收入，城市基础设施配套费收入，小型水库移民扶助基金收入，重大水利工程建设基金收入，车辆通行费，船舶港务费，学校收费，教育考试考务费，体育部门收费，司法部门的涉外、涉港澳台公证书工本费，贸促会收费，其他政府性基金收入。(www.daowen.com)

在以上基金预算收入的项级科目中，有些还可根据需要设置目级科目。例如，“学校收费”项级科目分设“教育部门普通高中学费”“教育部门普通高中住宿费”“教育部门高等学校学费”“教育部门高等学校住宿费”等目级科目，等等。与“一般预算收入”科目一样，以上“转移性收入”科目在《政府收支分类科目》中属于“基金预算收入”科目，但在财政总预算会计核算收入时，不作为“基金预算收入”会计科目核算，而作为“补助收入”“上解收入”“调入资金”等会计科目核算。