由于搬目连所具有的独特内容及其宗教性，决定了它演出程序的特殊性。目连戏的演出程序，主要包括两个方面，一是上演剧目的演出顺序，二是神事活动的穿插安排。从上演剧目安排来看，《梁传》在前，《黄巢》在后，《目连传》居其中，这个顺序是不能颠倒的，因为它们的内容是讲述目连的生前、在世和身后之事，在川剧中被称为前目连、正目连和后目连，其他剧目则可以灵活地进行安排，并无一定之规。只是《红鸾配》的演出大多是安排在《接刘氏》时进行，这似乎已经成为一条约定俗成的规矩。从神事活动的安排来说，也有一些虽不十分固定但大体一致的程序。比如开台时的灵官镇台、放五猖、捉寒林，《接刘氏》中的回车马仪式，打叉前的祭叉、游叉，挂郗氏幡、目连幡、摆焰口、放河灯等等，有的必须有，有的可省略，视情况而定。一般来说，这些演出程序都须按一定的顺序进行，比如灵官镇台，必定是在开台第一天，因为它能镇压妖魔，消除秽气，起到保佑演出平安的作用。再如放五猖、捉寒林必须在演出之前，这些都是不可更改的仪式程序。打叉表演、游叉祭叉仪式也不可或缺，这是出于保境安民的需要。也有一些可以省略的仪式，比如演出前目连《梁传》之时，每当演至郗氏变蟒，舞台上要挂起郗氏幡；在《目连挂灯》一场中要挂目连幡，也是尽人皆知的演出习俗。但如果因为演出时间短，或者主办方财力不足，则可以省略，观众也不会有意见。

此外，目连戏中有一些特殊的演出场面和表演绝技，由于多为目连戏所独有，也成为搬目连中一种具有特色的演出习俗。失去这些特色，观众就会感到极大的不满足。比如打叉，虽然其他剧目中也偶尔有打叉的表演，但都没有目连戏的打叉那样精彩，且这种打叉的绝技融入惩恶的剧情之后，更具有一种不同凡响的震慑力，成为目连戏在表演上的一大特色，因而在四川乡间目连戏俗称为“打叉戏”。这种表演技巧进而演变为人们的一种看戏的习惯，如果不打叉，绝对不叫目连戏。哪怕是木偶戏搬目连，也必须打叉。正因为如此，打叉的技巧越来越精彩，内容也越来越丰富，观众的认同也越来越趋向一致，打叉也就成了目连戏演出必不可少的内容，并形成了独特的打叉规制。(www.daowen.com)

“打加官”又叫“跳加官”，是传统戏曲演出时进行的一种礼宾习俗，也是戏班出于应付场面或收取钱财的需要，在演出中临时插入一些礼仪性的程序。比如，在演出过程中，因某会首、老爷驾到或离场，正在演出的戏即可戛然而止，而吹奏迎送曲，或打加官以示隆重礼迎。加官戴纸壳面具，笑模笑样，手持一条幅进行一些简单欢乐的身段表演，条幅上书“福禄寿禧”“指日高升”之类的吉祥话语，以示祝福之意。如果会首给了赏钱，打加官结束之后，戏班管事便登台高声宣布，某某发赏银多少，然后继续演戏。当然这并不是每场戏都有，但只要有这样的机会，戏班的管事是不会放过的。