为保持上海港水面清洁，1975年起，市清洁所水上清洁管理站（以下简称“水清站”）开始在苏州河水域内人工小范围巡回打捞水面漂浮垃圾，但无计划任务。1980年，水清站成立内港分站和外港分站，分别负责苏州河和黄浦江及有关支港的水面漂浮垃圾打捞作业，列入水域保洁计划任务，至年底，共有职工997人，配备大小机动作业船24艘、木驳船27艘。

1984年，经市政府批准，在水清站的基础上，建立上海市水上环境卫生管理处，负责全市水域环境卫生管理和承担黄浦江及苏州河包括支港水域水面漂浮垃圾打捞作业。1985年起，国内第一艘双体水面清扫船在黄浦江水域投入使用，黄浦江段内开始实行机械船清扫与人工打捞相结合、定点打捞与巡回打捞相结合的保洁作业方式。苏州河因湾道多、船舶多、垃圾少，外白渡桥向西仍采取人工打捞保洁作业方式。同年，市水管处调整保洁作业方式，先后在黄浦江、苏州河上设置19对拦网设施，配备打捞船，实施定人、定点、定时守候打捞的保洁作业方式。1989年，市环卫局制定《上海市环境卫生主要工种作业规范》，对水上环卫作业规范提出明确要求。1990年，市政府发布《上海市水域环境卫生管理规定》，市水管处开始组织黄浦江和苏州河沿岸的单位在水域责任区内自行打捞漂浮垃圾，责任区外水域有水上环卫作业单位负责打捞漂浮垃圾。

1992年，市环卫局改革水域环境卫生管理体制，市水管处调整内部结构，将内、外港管理站合并成立水上综合服务中心（以下简称“水服中心”），负责市直管水域的水面漂浮垃圾打捞作业。至1993年，共配备清洁工作船56艘、水面清扫船3艘、双体浮筏21艘。1994年，市水管处根据《上海市环境卫生水上作业质量标准、监察规范》，明确要求打捞水面漂浮垃圾做到“三捞”（作业点定人守候全日捞、漂浮垃圾聚集点适时捞、重要河段巡回捞），“二无”（受委托打捞的责任区内无2平方米以上漂浮垃圾聚集、作业船无垃圾暴露），市直管水域水面漂浮垃圾保洁作业质量得到提高。1995年，市水管处以创建国家卫生城市为主线，组织实施《水域环境卫生发展计划》和水域环境卫生竞赛活动计划，落实有效措施，切实做好市直管水域水面保洁工作。至年底，完成在黄浦江、苏州河上增设5处拦网固定打捞点，实现了市直管水域重点区域白天不见1.5平方米垃圾聚集点的保洁作业要求。

1996年，市水管处确定“理顺关系抓协调，作业服务抓实体，薄弱环境抓整治，控制污染抓源头，水面保洁抓实效”的工作重点，通过迎接全国人大环保检查团视察苏州河和开展“双高”“三迎”等活动，促进保洁作业服务质量的提高。承担市直管水域保洁的水服中心全力投入，突击整治脏源，增加打捞船和作业频次，使黄浦江景观水域和苏州河重点段水面有了较大改善。市直管水域保洁范围不断延伸至上海港内、外港区部分，苏州河、蕴藻浜、淀浦河等市区界内部分，虬江军工路桥东下游部分，虹口港嘉兴路桥南下游部分，定海港，龙华港龙吴路桥东下游部分。年底，水服中心有保洁作业人员483名，配备机动收集作业船42艘、非机动双体浮筏打捞船40艘。1998年，市水管处转换内部分配机制，提高市直管水域保洁水平。组织开展“爱岗敬业，争当服务标兵”百日竞赛活动，漂浮垃圾打捞量翻倍增加；开展与沿岸门责单位签订委托保洁协议书，实行承诺制服务，赢得了社会各界好评。同年，重点清除小陆家嘴滨江大道滩涂沉积垃圾，使黄浦江滨江大道水面状况得到了改善。

2000年，市水管处以苏州河、黄浦江中和治理为重点，建立市直管水域与沿岸单位“共管共建”长效管理机制；结合迎接APEC会议在沪召开，建立滨江大道水域保洁班，对小陆家嘴滨江大道采取每天水上巡回清扫和退潮后下河保洁相结合的作业方法，保证了滨江滩涂的整洁。巩固完善分段竞标、分配激励、考核监督三大机制，市直管水域水面保洁质量明显提高。2001年，水服中心等4个单位从市水管处整建制划归市废弃物处置公司（以下简称“处置公司”），市直管水域开始实行管理和作业分开。同年，市水管处明确提出“一江（黄浦江）、一河（苏州河）、一环（内环线）、一线（浦东机场至虹桥机场沿线）”水域市容环境卫生整治工作要求，水服中心全力落实各项措施，市直管水域水面保洁质量稳步提升。

2003年，市水管处以市直管水域为重点，加强基础工作，划分水域范围，制定保洁标准，建立日查、周考、月联考的检查机制；实施双向告知制度和联席会议制度，加强与处置公司协调沟通；延长工作时间，实施两班制和轮休制，对13个垃圾易聚集点重点监控；加大监管力度，发现问题，直接由一线监管人员通知保洁队及时清除，改善了黄浦江两桥（杨浦、南浦）之间和苏州河长寿路桥以东水域的水面清洁状况。市水管处投入70多万元，在黄浦江、苏州河主干流上设置6个监控点、1个主控中心的全天候视频监控设施，实施“控制、作业、缓冲、禁止”四大区域分区监控预警机制。水服中心调整保洁作业方式，实行以机械打捞船与定人、定点、定时守候清除水面漂浮垃圾相结合的保洁作业方式。分类保洁作业方式有效地控制了单位生产成本，提高了水域保洁作业质量。(www.daowen.com)

2004年，市水管处加强水域市容环卫质量监管信息系统建设，建成水域视频监控子系统、水面质量巡查子系统、水面质量评价子系统、直管水域保洁作业管理信息子系统，以及苏州河水面市容环境卫生质量评估系统，包括监控系统、数据汇总系统、评价系统、报告系统，每日对苏州河水面质量做出实时评价。市直管水域水面保洁质量监控进入信息化管理。2005年，市水管处在黄浦江上选取“十点一区域”垃圾易聚集点作为采样点，试行建立黄浦江水面市容环卫质量评估系统，有效掌控水域市容环境质量。市直管水域保洁作业单位由改制后的上海市水域环境发展有限公司（以下简称“水域公司”）承担。水域公司积极落实暴露垃圾并联治理机制，在市直管水域进行整治11次，清除暴露垃圾1.7万余吨。全年市直管水域水面质量优良率稳定在93％以上。

2006年，市水管处完善《黄浦江、苏州河公共水域保洁招投标运作实施方案》，市直管水域实行保洁合同化管理。健全水面质量评价体系，公开公布质量指数，加强专业监管。水域公司全体职工发扬连续作战20天不休息的精神，完成“上海合作组织峰会”召开期间水域环境卫生保障任务，全年市直管水域水面质量优良率稳定在95％以上。2007年，市市容环卫局下发通知，首次明确市直管水域中景观水域范围为黄浦江：杨浦大桥至徐浦大桥水域部分，苏州河：东港口至中山路桥水域部分。市水管处深化合同管理，推行扣分还分考核机制，激励保洁单位注重整改，提升保洁水平，全年市直管水域水面质量优良率达到96％。同年，为世博会举办期间做好景观水域环境卫生保洁服务工作，水域公司自筹资金研制设计科技含量高、满足多功能需求的游艇式保洁船。全面履行市管水域保洁合同，完成“一江一河”的保洁任务。

2008年3月，根据市市容环境综合建设和管理工作联席会议办公室的整治要求，市市容环卫局下发《关于进一步加强本市水域保洁管理的通知》，要求加强对黄浦江关港下游、苏州河华漕下游等市直管水域保洁作业管理要求。市水管处在与作业单位签订合同中增加滩涂、易聚集点等方面考核内容，首次将市民评价分值纳入考核。同年，游艇式保洁船投入日常保洁作业。水域公司根据全市河网水系流向特点，按照“合理、有效、坚固、美观”的基本要求，在黄浦江、苏州河上使用钢桩、铁质围栏、铁质囤船、机械化打捞设施等方法设置了16对定点拦截打捞设施，增强拦截作业能力，防范漂浮废弃物对黄浦江、苏州河中心城区段污染，满足“全天候”拦截和打捞漂浮废弃物要求，提升了水域保洁作业整体水平。水域公司根据管理要求，调整作业结构、延长作业时间、加大考核力度，全方位履行保洁责任，与市水管处建立信息互通平台和工作例会制度，定期交流工作难点，及时整改存在问题。2009年，市绿化市容局下发《关于印发上海市主要道路（河道）和景观区域（水域）范围界定的通知》，确定市直管水域保洁范围为黄浦江：杨浦大桥至鳗鲤嘴长桥港口，苏州河：东港口至真北路桥。市水管处在优化市直管水域保洁作业质量的基础上，开展调查研究，拓展保洁水域段面，编制市直管水域50千米整治方案，确定16对拦截打捞设施的位置及形式，组织相关作业、建设、监理的招投标，指导开展专项整治工作。水域公司履行市直管水域保洁合同，在黄浦江、苏州河上打捞出水面漂浮垃圾7002吨，与同期相比增加35％，出动船舶1030艘次，出动人员5500人次，清除景观水域段和50千米重要水域内产生的垃圾5200吨。

2010年，成立世博会水域市容环境保障指挥中心，市水管处整合作业、管理、执法资源，建立信息日报评价制度，强化监管效能。规范各类船舶容貌和容器，遏制污染水域行为的发生。水域公司成立世博水域保障运营项目部，建立公司领导带班、部门负责人主值班、执行值班员三级值班制度，不定期对保洁船舶调度和质量巡视进行考核，重点加强保洁作业现场质量监管，编制应急预案，建立核心水域、外围水域、沿海防区“三位一体”应急保障体系，调拨“沪环货117”轮，24小时临战待命，实时保障水域运营安全。协调界定区域保洁责任，落实船舶停泊及相关设施配套和水面垃圾处置。针对日常保洁和50千米整治区域不同条件，分别采取机械清扫、人工保洁、布设围油栏、小型橡皮艇特殊打捞等方法，从上午6时至晚上10时对世博园区核心水域进行不间断、全方位、精细化保洁作业，使世博园区核心区水域环境卫生面貌达到整洁标准。世博会开幕式后，水域公司职工奋战数小时，在黄浦江上及时完成打捞漂浮的发光球只、清扫焰火残骸及各类漂浮垃圾等应急任务。世博会举办期间，处理救助失控游艇、落水人员等各类应急事件7起，并成功处置1起沉船溢油污染事故。