从水资源持续利用规划概念出发，水资源持续利用规划的指导思想应以开发资源、增长经济、保护环境和社会发展4个方面的协调为准绳，以可持续发展为目的，维持全社会的不断进步与发展。水资源利用和环境保护是生态经济系统的组成部分，其规划需以生态、经济系统理论为基础，以生态、经济规律为指导，在开发利用资源、环境，满足社会、经济发展需要的同时，必须保证生态环境良性循环和发展。水资源持续利用规划的指导思想概括为以下几点：

1）综合考虑社会效益、经济效益和环境效益，确保社会、经济发展与水资源利用、生态环境保护相协调。

2）考虑水资源的可承载能力，使水资源在可持续利用的允许范围内，确保当代人与后代人的协调。

3）不仅与社会经济发展密切结合，还要与社会经济发展水平相适应，确保人与自然的协调以及水资源规划方案在现有条件下是可行的。

4）从区域或流域整体出发，考虑流域上下游以及不同区域用水间的平衡，确保区域社会经济持续协调发展。

进行水资源持续利用规划与管理的基本方法是系统科学的整体方法，并结合应用其他自然和社会科学理论的多学科协作交叉的方法，对宏观和微观层次的水资源开发利用、治理问题进行系统分析、综合规划和科学管理。(www.daowen.com)

水资源持续利用规划旨在支持生态环境与经济社会的协调、持续发展，并使自身得以永续地利用，因此遵循可持续发展原则和支持条件是非常必要的。同时结合水资源本身的规划特点，还要遵循下列几点主要原则：

1）贯彻执行有关法律、规范，如《中华人民共和国水法》、《中华人民共和国水污染防治法》、《中华人民共和国水土保持法》、《中华人民共和国环境保护法》等。

2）以生态环境与经济社会相协调，并能实现可持续发展和经济、社会、环境综合效益最佳为原则。

3）把水资源本身看成一个系统，从整体的高度、全局的观点，来分析规划水资源系统，保证总体最优的目标。

4）因地制宜、统筹兼顾原则。水资源的时空特性非常突出，水资源持续利用规划必须因地制宜，开发利用与治灾兼顾，重点与一般统筹，实事求是地全面规划，综合利用环境与资源，促进经济社会的持续发展。