FSMP GMP中有6条术语和定义，分别是“特殊医学用途配方食品”“清洁作业区”“准清洁作业区”“一般作业区”“商业无菌”“无菌灌装”。

“特殊医学用途配方食品”的定义主要参考了国际食品法典标准CODEX STAN 181—1991和欧盟关于特殊医学用途配方食品的指令（COMMISSION DIRECTIVE 1999/21/EC）中对于该类产品的定义。

根据空气洁净度等级符合洁净厂房设计规范（如GB 50073—2013《洁净厂房设计规范》、GB 50457—2017《医药工业洁净厂房设计规范》）规定为特征，设置“清洁作业区”，它是指对区（车间）内的洁净度有特殊要求，对空气中的尘粒、温度、湿度、压力等进行控制的封闭车间（或作业区域），目的是为了保证最终产品不被污染。

“准清洁作业区”主要是指原辅料预处理车间，也包括必要时为控制进入清洁作业区的物料达到一定清洁要求而需要设置的区域。它的清洁度要求低于清洁作业区。

而对于“一般作业区”，虽然没有空气中的菌落检测的标准和要求，但要求其环境应符合最起码的食品企业的卫生要求。(www.daowen.com)

本规范中的“商业无菌”主要针对的是液态产品，其定义是引用源于罐头食品商业无菌的概念，其检验方法应按GB 4789.26—2013《食品安全国家标准 食品微生物学检验 商业无菌检验》的规定执行。

“无菌灌装”，顾名思义整个操作必须是在无菌条件下完成，也就是说所有涉及的物料、包装容器（含盖）、接触食品的设备或灌装区域等在灌装前应均处于商业无菌的状态。

此外，GB 14881—2013《食品安全国家标准 食品生产通用卫生规范》中的9条术语和定义也适用于FSMP GMP。药品GMP的附则中有42条术语和定义，比前者多，且更难于理解。这里不再一一阐述和解释，可见附录原文。