《补充报告》提出工程采取“一次立项，分期配水”的建设方案，按照关中用水量逐步增长过程，2020年配水5亿立方米、2025年配水10亿立方米、2030年配水15亿立方米。为实现上述目标，首先建成三河口水利枢纽和秦岭隧洞，满足2020年的配水要求，然后建设黄金峡水利枢纽、黄金峡泵站和黄三隧洞，实现2025年和2030年的配水要求。

评估认为，三河口水利枢纽是座多年调节水库，调节子午河流域的径流，可以满足2020年配水5亿立方米的目标。由于配水连续逐年增加，各项工程建设必须相互衔接，按配水要求安排资金和投产工期，既不造成投资积压，又能满足持续配水的要求。因此，引汉济渭工程应根据用水需要，分阶段建设。(www.daowen.com)

工程施工部署及总工期为：黄金峡水利枢纽、黄金峡泵站、黄三隧洞、三河口水利枢纽和秦岭隧洞5个单项工程施工工期分别为黄金峡水库48个月、黄金峡泵站42个月、黄三隧洞51个月、三河口水利枢纽48个月、秦岭隧洞79个月。从降低工程施工强度，合理分配资金投入，边建设边受益的角度出发，分序安排各单项工程施工。秦岭隧洞和三河口水库先开工，相继安排黄金峡水利枢纽、黄金峡泵站、黄三隧洞等工程，工程施工总工期为11年。