坐标系方法给出了单位晶胞中每个质点的空间坐标。这有助于了解晶体结构及每个质点的位置。特别是在用计算材料学方法研究晶体材料时，这些坐标有助于我们在晶胞中的相应位置添加原子。坐标系有笛卡儿坐标和分数坐标两种形式。笛卡儿坐标常用来表示非周期结构和晶格中质点的绝对位置，比如金属Cr属于体心立方结构（图2.27），a=b=c=2.88Å，其体心位Cr原子的坐标为（1.44，1.44，1.44）。采用这种方式，我们需要知道具体的晶格常数a、b、c。而具有同样晶体结构的晶体，其晶格常数不同，如CsCl晶体结构也是体心立方，其a=b=c=4.11Å，但其体心位原子的坐标却为（2.055，2.055，2.055），所以用笛卡儿坐标来描述同一类型的晶体结构不方便。(www.daowen.com)

在笛卡儿坐标的基础上，人们采用分数坐标来表示质点在晶胞中的相对位置，而不是绝对位置。以体心立方结构为例，体心位原子在三个轴上的坐标分别是晶胞每条边长的一半，于是我们用0.5表示其相对位置。这样，体心原子坐标就成了（0.5，0.5，0.5）。体心位原子的这种表示不仅可用于Cr、CsCl晶胞，而且还可用于所有体心立方晶体结构。再比如Cu晶胞的四个原子，其分数坐标分别为（0，0，0）、（0，0.5，0.5）、（0.5，0，0.5）、（0.5，0.5，0）。用分数坐标描述晶体结构显得简单明了。