保护区湿地包括天然湿地和人工湿地两大类4个类型11个类别。其中：天然湿地包括永久性河流、季节性河流、泛洪平原湿地、永久性淡水湖、季节性淡水湖、草本沼泽、灌丛湿地、内陆盐沼8个类别；人工湿地包括池塘、灌溉渠系及稻田、蓄水区3个类别。

保护区多样化的湿地类型为多种生物的栖息生长提供了良好的生境，保护区内动植物资源丰富，生物多样性显著。

保护区种子植物53科173属311种（含种下等级，不含栽培种）。其中，裸子植物1科1属3种，即麻黄科、麻黄属3种；被子植物中，双子叶植物40科133属244种，单子叶植物12科39属64种。属于国家I级保护的植物有裸果木和绵刺2种；国家II级保护的植物有8种：中麻黄、沙拐枣、斧翅沙芥、梭梭、华北驼绒藜、蒙古扁桃、黄芪、肉苁蓉。

分布于保护区的野生脊椎动物209种，其中哺乳类24种，鸟类155种，两栖爬行类11种，鱼类19种。在保护区各类别湿地中，栖息着《湿地公约》规定的水禽65种，占我国《湿地公约》规定水禽种数的25.10%，占保护区鸟类种数的41.29%，其中繁殖种类41种。湿地鸟类群落中鸻形目、雁形目和鹳形目占明显优势，分别有21种、20种和8种。保护区已记录的昆虫892种，隶属于12目114科578属，其中甘肃省新纪录130种，珍稀昆虫11种。昆虫种类以鳞翅目（319种，占35.76%）和鞘翅目（217种，占24.33 %）昆虫占优势，区系成分以中亚耐干旱种类为主。

保护区内珍稀野生动物丰富，列入国家重点保护野生动物名录的种类有28种（I级6种，II级22种）；其中国家I级保护的物种全为鸟类：黑鹳、金雕、玉带海雕、白尾海雕、大鸨、遗鸥。国家II级保护的物种有白琵鹭、大天鹅、小天鹅、鹗、鸢、苍鹰、白头鹞、棕尾、大、毛脚、短趾雕、红隼、燕隼、灰鹤、雕鸮、短耳鸮、纵纹腹小鸮、长耳鸮以及哺乳动物草原斑猫、猞猁、兔狲、鹅喉羚。列入濒危野生动植物种国际贸易公约（CITES）附录的有25种，其中列入附录I的2种：白尾海雕、遗鸥，列入附录II的23种。

保护区生活着上百只的黑鹳种群，湿地生境繁殖的还有苍鹭、白琵鹭、灰雁等41种水禽，群落多样性指数相当高；在春秋鸟类迁徙季节，保护区的湖泊水库湿地可见到大天鹅、灰雁以及赤麻鸭、绿头鸭、赤嘴潜鸭等水禽成几百甚至上千成万只以上的大群。毫无疑问，保护区对于水禽无论在繁殖还是迁徙和越冬方面都具有重要意义。(www.daowen.com)

此外，保护区分布的甘肃省重点保护野生动物有7种：大白鹭、灰雁、斑头雁、红嘴潜鸭、渔鸥、狐、祁连裸鲤，其中5种鸟类占甘肃省重点保护鸟类的50%。被列入中日保护候鸟及其栖息环境协定的鸟类有73种，中澳候鸟保护协定的鸟类23种，国家保护的“三有”（有益的或者有重要经济、科学研究价值）的野生脊椎动物126种，甘肃省保护的“三有”25种。

保护区内珍稀野生动物丰富，列入国家重点保护野生动物名录的种类有28种（I级6种，II级22种）；其中国家I级保护的物种全为鸟类：黑鹳、金雕、玉带海雕、白尾海雕、大鸨、遗鸥。国家II级保护的物种有白琵鹭、大天鹅、小天鹅、鹗、鸢、苍鹰、白头鹞、棕尾、大、毛脚、短趾雕、红隼、燕隼、灰鹤、雕鸮、短耳鸮、纵纹腹小鸮、长耳鸮以及哺乳动物草原斑猫、猞猁、兔狲、鹅喉羚。列入濒危野生动植物种国际贸易公约（CITES）附录的有25种，其中列入附录I的2种：白尾海雕、遗鸥，列入附录II的23种。

保护区生活着上百只的黑鹳种群，湿地生境繁殖的还有苍鹭、白琵鹭、灰雁等41种水禽，群落多样性指数相当高；在春秋鸟类迁徙季节，保护区的湖泊水库湿地可见到大天鹅、灰雁以及赤麻鸭、绿头鸭、赤嘴潜鸭等水禽成几百甚至上千成万只以上的大群。毫无疑问，保护区对于水禽无论在繁殖还是迁徙和越冬方面都具有重要意义。

此外，保护区分布的甘肃省重点保护野生动物有7种：大白鹭、灰雁、斑头雁、红嘴潜鸭、渔鸥、狐、祁连裸鲤，其中5种鸟类占甘肃省重点保护鸟类的50%。被列入中日保护候鸟及其栖息环境协定的鸟类有73种，中澳候鸟保护协定的鸟类23种，国家保护的“三有”（有益的或者有重要经济、科学研究价值）的野生脊椎动物126种，甘肃省保护的“三有”25种。