生态水工学的发展，将河道传统水利推向水利与原生态系统相交互的阶段。目前河道治理技术已完全认同传统治理模式与生态治理模式的协同应用。生态治理技术发展日新月异，从物理、化学法、传统生态种群修复发展到微生物治理技术。在国内河道整治市场已开展很多微生物修复技术工程，在各种培训上该技术的推广力度越来越大，微生物消除水体污染物技术在研究和实践层面都有了一定的成效。

物理方法主要有截污控源、底泥疏浚、沟通水系、引清调水（机械增加水体动力增加水体交换）、人工曝气等。其优点是治标治本、应急处置、见效快、效果好、投资省，缺点是二次污染可能性大，淤泥的转移带来污染的转移。

化学法主要有化学除藻、絮凝沉淀、调节水体p H值等，优点是见效快，缺点是治标不治本，容易二次污染，容易反弹。

生态法主要是以人工干预的手法部分恢复河道部分自然生态，待河道本身形成本地化的生态群落，最终建立良好的水生态环境。主要有设计河道断面、河道植物群落布置、水生动物放养等措施，应用广泛的有生态浮岛、人工湿地等。优点是可持续的良性发展，缺点是投资大、周期长、需要长效管理，适用于生态恢复力强的地区，如长三角平原。(www.daowen.com)

生物法主要有微生物菌剂、底泥生物修复、生物膜法、稳定塘等技术。优点是见效快、便于管理，缺点是适用面较小，不适合大江大河以及流域的治理。

近年来，国内已普遍的认识到人为控制因素改变了河道水力特性、降低了河道纳污能力，因此在河道整治中截污纳管已列为首选措施，河道治理理念从单一目标和治理方式向着多维目标和多种组合技术工艺治理措施转变，最重要的是区域水环境治理需要高起点规划、综合治理、全面实施，以流域综合治理理念为导向，建立有效的长效管理网络，最终建立健康、可持续的河道水生态系统。