监测管理主要包括：实验室自动化数据管理、移动实验室数据收集处理、自动站数据收集处理、排污口数据自动收集处理。

（1）实验室自动化数据管理。实验室数据管理主要包括：分析仪器数据的自动采集，实验读数量值转换，水样身份管理，原始报表生成，数据质量认证，数据在站资料整编，实验室质量控制等。按水资源保护规范要求，对原始数据资料进行汇总、合理性分析、数据验证、整理、入库等处理。各基层水资源保护局利用该系统通过计算机网络将数据发送到流域监控中心，经处理后，写入水资源保护综合数据库。

（2）移动实验室数据收集处理。流域的水质监测战线长，任务量大，对距离较远的站点、临时设置的监测站点和突发性污染事故的跟踪监测，都需要借助于移动实验室完成。

移动实验室的主要功能是通过实时水质数据 （污染类别及参数）采集，配合数字地图、利用卫星地面定位，将监测数据、水污染事故发生地的经纬度坐标数据等，通过卫星传输方式传送到监控中心。(www.daowen.com)

（3）自动站数据收集处理。在流域重点省界河段、重要供水水源地和重点污染河段建成自动监测站，各自动监测站将监测到的水质数据 （多种水质因子参数），利用网络传输方式或有线电话和GSM数据传输方式或卫星数据传输方式等进行数据传输。一般情况，直接将数据传送到流域监控中心。监控中心根据数据特性、用途进行合理性分析和处理，存入水资源保护实时监测数据库。

（4）排污口数据自动收集处理。根据流域城市工业的分布情况，在流域干流主要重点排污口建设若干个自动监测仪。对一些企业的偷排、乱排污水状况进行实时自动监测，为监督管理提供依据。

自动监测仪是将设置的几个水质因子参数进行自动监测，当测定的水质因子超标时，将数据传送到各基层水资源保护局。传输方式根据当地情况而定，一般有电话方式、GMS无线方式和卫星传输方式等。