根据前文分析，对于一个发展中大国存在的内部不平衡，会出现地区结构差异、要素流动和技术扩散等经济现象。这些经济现象都表明各地的要素产出弹性和全要素生产率存在差异，而在测算潜在经济增长率时不能忽视这种区域差异。因此，我们必须针对各地禀赋结构的不同，分别估算各地的要素产出弹性和全要素生产率。然后，根据模型的估计结果和要素产出弹性，代入估算出的各地潜在就业、资本存量和人力资本存量，估计出经济的潜在产出，并将各地潜在产出加总得到全国总潜在产出，进一步计算得出潜在经济增长率。

为了测算分析的方便，本文采取的测算模型仍然以附加人力资本的索洛模型为基础，首先设定测算模型为如下形式：

在式（1）中，Y代表总产出，A代表全要素生产率，在增长核算中表现为索洛余值，α代表资本边际产出弹性，β代表劳动边际产出弹性，γ代表人力资本的边际产出弹性。为了反映空间异质性对潜在经济增长率的影响，我们将要素边际产出弹性和全要素增长率定义为反映区域个体特征的函数式，从而将区域结构内生于生产函数中，进一步将生产函数扩展为如下形式：(www.daowen.com)

对上式两边取自然对数后可得到：

对于上式而言，可以采取的估计方式有两种：一是基于各个地区的数据进行单独估计，从而得到各个省区的各要素产出弹性，但这种方式显然将各个省区作为独立的经济体，忽略了省区之间扰动项相关的可能性。考虑到政府在1994年分税制后在经济上集权的特征，各省区接受政府宏观调控的力度逐渐加大，这种估计方式欠妥。而仅仅从数据上来看，对每一个省区进行单独回归也会由于样本过少而损失估计的准确性。另一种估计方法是采取面板SUR方法对模型进行系统估计，这种方法考虑了不同省份可能面临相同的宏观政策等因素，也就是考虑了各个估计个体的干扰项可能相关的情况，也就更为适合用于本文对于潜在经济增长率的核算。