调整水利水电工程的运行方式，把生态调度纳入工程的统一调度管理，是保护生态、环境的重要和必要手段。生态调度以补偿河流生态系统对水量、水质、水温等环境需求为目标，通过科学调度减缓下游流量人工化、下泄低温水、过饱和气体等不利环境影响等对河流生态系统的胁迫。发达国家已进入工程的全面管理阶段，以修复河流自然径流过程为基础，经过20～30年的生态调度的实践，取得了良好的效果。如法国、美国、日本、德国、澳大利亚等，在保障防洪安全，不显著改变发电、灌溉等工程效益的条件下，调节下泄流量的时间序列，尽可能恢复下游水流的自然节律过程，通过人造洪峰等重现自然水位涨落，并调节水质、水温和泥沙冲淤，恢复自然生境，修复河流生态。如美国科罗拉多河的人造洪水试验，对恢复格伦峡大坝下游河流与洪泛平原的联系，重塑退化的河流生境和生态功能，起到了良好效果。

合理补偿工程建设对生态环境的不利影响，近年来在我国也开始得到一定的重视。如长江流域在规划龙盘水电工程时，选定了发电的下泄流量不得低于生态基流300m3/s，以满足下游基本生态需水和景观要求；在黄河小浪底水库进行的调水调沙试验，利用人造洪峰输沙入海，减轻下游河道的淤积。黄河流域已连续5年实施统一调度，保证入海水量，消除了枯水季节河道断流的情况；丹江口水电站为控制汉江下游水体富营养化，加大枯季下泄流量；太湖流域调整河网地区闸坝运行方式，促进水流交换改善水质等，都是生态调度的有益尝试。近年来我国水利水电设计部门及业主也在工程的设计规划阶段开始重视生态调度，如通过在工程设计中考虑采取分层取水设施以调整下泄水温等。但仍应认识到，我国距真正实施水利水电工程运行中的有效生态调度尚有巨大的差距。我国具有多年调节的水库数量并不多，缺水现象比较严重，暴雨洪水集中在汛期的3～4个月，如何协调这些矛盾，并满足生态蓄水要求，其难度还相当大。因此，建立以生态保护为目标的运行和长效管理机制是一项复杂的任务。(www.daowen.com)