从实际运行情况来看，新型农村合作医疗制度不仅有效缓解了农民因病致贫的困难，而且取得了明显的政治、经济和社会效应，主要表现在以下几个方面：

（1）重塑了政府形象

新型农村合作医疗制度体现了政府切实解决农民问题的决心，体现了政府对农民医疗健康状况的深切关注。政府兑现了对参合农民的财政补助，截至2005年年底，地方各级财政补助达到了52.55亿元，中央财政对中西部地区补助11.92亿元。

（2）带动了农村民主建设

在不少合作医疗试点地区，在合作医疗管理委员会中有农民的代表在行使管理权和监督权；对农民医疗费用补偿的情况，规定以村为单位，定期向农民公布，保证了农民的知情权，提高了农民监督合作医疗实施情况的积极性。新型农村合作医疗的实施在一定程度上激发了民主意识，推动了农村民主的发展。(www.daowen.com)

（3）促进了农村医疗服务能力的提高

县、乡镇、村三级医疗卫生机构是我国农村的医疗服务网，他们提供了绝大多数农民的医疗服务。在新型农村合作医疗制度推进过程中，乡镇卫生院、村卫生室的服务能力建设成为重要的配套措施，与过去比，农村医疗卫生服务能力有所提高。

（4）改善了社会“大公平”

在中国，最大的不公平是城乡之间的不公平。“大公平”得不到改善，局限于“小公平”上做文章，整个社会公平难以有实质性进展。新型农村合作医疗制度最显著的作用是，为政府扩大对农村医疗卫生投入提供了一个制度平台，缓解了城乡之间长期形成的不公平状况，使农民开始与城镇居民一样，享受到医疗费用的补偿，尽管现在的补偿水平还有差距，但毕竟改变了过去长期以来形成的向城镇居民“一边倒”的状况。