完善对资金的管理，要做到以下几个方面：

（1）完善管理规章制度

实现科学管理，首先必须建章立制，有了健全的规章制度，合作医疗的规范运作就有了可靠的保证。要加强筹资与补偿比的科学测算，确立科学的筹资与补偿标准，防止资金透支或沉淀，在此基础上制定科学的合作医疗实施办法、基本药物目录、诊疗目录等和相关具体规章制度，如报销、财务、报表、培训、宣传、定点服务机构、转诊等制度和参合者守则等。要以合同的形式明确供、需、管三方的权利、义务和责任。要统一科学设计并印刷有关合作医疗运行的各种必备材料，包括合作医疗证、合同书、专用处方、参合登记簿、报销登记簿、有关报表等，规范合管办的具体操作。在合作医疗实施过程中，要加强督导检查和奖惩，发现问题及时处理，确保合作医疗资金安全，确保合作医疗制度得到认真贯彻执行，促进合作医疗规范运作。

（2）健全合作医疗管理组织机构

合作医疗管理组织机构是开展合作医疗工作的必要载体，在新型农村合作医疗实施过程中，以合作医疗资金的运作为主线，合作医疗资金筹集、补偿、管理等工作的有效开展都离不开合作医疗管理组织机构。要成立新型农村合作医疗管理委员会及办公室，县合管办一般设在卫生局，镇合管办一般设在卫生院，人员从卫生部门内部调剂。必须落实县、镇合管办人员编制，设立专职工作人员，落实其人员和工作经费，保证对合作医疗工作投入充足的人力和精力，促进新型农村合作医疗工作的正常开展。要确立科学的与合作医疗实施办法相协调的管理体制，合理分配和划分县、镇、村三级合管机构的职能。

（3）加强合作医疗管理硬件配置(www.daowen.com)

新型农村合作医疗的顺利实施还需要有坚强的硬件配置保障和良好的工作环境。硬件配置主要是指合管办的办公房屋和设备的配置，也包括定点服务机构的基础建设和设备投入。合管办必备的办公条件包括办公室数间（报销室、财务室和主任室等）、资料橱、相关办公用品等。微机化管理是新型农村合作医疗发展的趋势，也是其规范化运作的必由之路，必须创造条件为合管办配备微机和管理软件，实现新型农村合作医疗的微机化和网络化管理。

（4）应用现代管理理念与技术

我们要应用现代的管理理念、技术、原则与方法，促进新型农村合作医疗管理更科学、更先进，并不断发展。例如，在新型农村合作医疗政策的制定和执行中，应用以人为本的理念，以农民满意为目标和归宿，尊重农民，给予参合农民更多的权利，包括参与管理权、医药费补偿权、自由择医权、知情权、监督权等，并创造条件，使得他们的各种权利得以充分行使。在实践中，我们还要认真借鉴医疗保险的管理原则和方法，不断完善新型农村合作医疗制度。

（5）强化民主监督

民主监督是规范和约束社会行为的必要途径，对合作医疗的民主监督将有力地保障合作医疗工作的规范开展。通过民主监督，合作医疗管理机构、定点服务机构和参合农民可以加强联系和沟通，形成良性互动，保障各方尤其是农民的应有权益。