当前我国农村基本社会保障中存在以下一些问题：

（1）农村社会保障资金投入不足

我国农村社会保障存在的根本问题就是保障资金不足，从社会保障资金的来源来看，通常是个人、集体（或企业）和国家各投入一部分，并且国家的投入应占最大的比例。当前我国财政对农村基本社会保障投入严重不足是造成整个农村社会保障资金不足的主要原因。

据有关调查显示，占总人口20%的城镇居民享受着89%的国家社会保障资源，而占人口80%的农村居民，仅享受11%的社会保障投入，在县城以下集体单位的一千多万职工和两千多万城镇个体经营者基本上得不到应有的社会保障权利。

（2）农村社会保障水平低，覆盖面窄(www.daowen.com)

当前农村以养老、医疗为重点的社会保障工作仅在小范围内进行，并没有按法律、政策规定的那样，凡是符合条件的农民都能参加社会保障。这样，本应由社会统一承担的社会保障项目转嫁给了社区集体或企业，变成了“企业保障”、“社区保障”，加重了村集体与企业的负担，社会保障基金的互济性不能得到充分发挥，全国虽有1100个县开办养老保险，但参加人口不到10%。

（3）农村社会保障资金管理水平低下

我国没有建立一个专门对农村社会保障资金进行高效管理的机构，城乡分割，条块分割，多头管理的情况非常严重。从管理机构上看，部分地区在国有企业工作的农村职工的社会保障统筹归劳动部门管理，医疗保障归卫生部门和劳动者所在的单位或乡村集体共同管理，农村养老和优抚救济归民政部门管理，一些地方的乡村或乡镇企业也制定了社会保障办法和规定。由于这些部门所处的地位和利益关系不同，在社会保障的管理和决策上经常发生矛盾，而且，政事不分，缺乏监督，使本来已经够乱的管理体制更加混乱，致使农村社会保障基金管理缺乏约束，漏洞较多，基金流失严重。