根据考夫曼的理论，适合度反映了多个系统元素相互依赖、相互耦合的整体性的配置状态。所以，可以认为重大科技工程技术创新系统组织协同适合度景观的爬升过程就是系统寻求组织协同最佳状态的过程，也即组织协同效率的提升过程。组织协同适合度景观的演变，正说明了创新主体组织协同的演变过程。具体而言，对于重大科技工程技术创新系统来讲，系统组织协同的适合度是指创新系统各创新主体在组织协同演变过程中，各协同组成要素之间相互作用进而促进组织协同发展的复杂状态反应。关于重大科技工程技术创新系统组织协同适合度的影响因素，因重大科技工程自身的特殊性而涉及很多，本节提炼其主要因素并将其概括为四个方面：协同核心群体、协同参与成员、协同平台以及协同复杂水平。其中，协同核心群体是指在系统组织协同各阶段围绕某一核心企业形成的处于核心地位的多个创新主体，协同核心群体对系统的组织协同效率起关键性决定作用，在系统的组织协同过程中，更多的是指创新系统的核心企业群体；协同参与成员主要指系统组织协同过程中配合协同核心群体进行协同创新的其他创新主体，包括创新活动的各个参与方，即创新参与组织、政府、科研机构、中介组织等，当核心企业不作为协同主体时，核心企业也属于协同参与成员的范畴；协同平台是指系统内部能够促进系统组织协同的各种有利条件，包括各种协同技术和协同资源，如资金、设备、人力资源、知识、信息等，广义的协同平台还包括协同文化，即系统组织协同过程中形成的有利于各创新主体树立正确协同观念的系统文化氛围，以及协同过程中核心组织树立的协同创新理念等；协同复杂水平是指协同成员之间因进行组织协同行为而发生的相互影响关系所表现出的复杂度。

在系统组织协同过程中，不同要素的不同能力状态和耦合方式，导致重大科技工程技术创新系统组织协同活动对外部环境变化的反应程度不同，进而具有不同的组织协同效率，产生不同的组织协同效果，最后形成组织协同的适合度景观。重大科技工程技术创新系统组织协同的这四个要素相互影响、相互依赖，四个要素之间的相互非线性作用及它们之间的相互组合和配置的状态影响着重大科技工程技术创新系统的组织协同适合度。具体来讲，各要素之间相互作用、相互依赖的非线性作用，使系统组织协同过程中，在调整某个或多个要素时会引起其他要素的互动和反馈，其内在联系或信息会成倍增加，即系统组织协同的复杂性将会增加，可能导致协同管理混乱局面的出现，从而组织协同的效能将不断减少、不断消耗，严重时造成系统组织协同的失稳。同时，各协同要素良好的能力及其不同状态的配置也能够增加创新系统组织协同的有序性，进而提高创新系统组织协同的运行效率，促进创新系统的演变进程[75]。正是由此，我们可以通过描述不同阶段的重大科技工程技术创新系统组织协同适合度来表示系统组织协同的运行效率。(www.daowen.com)

此外，重大科技工程技术创新系统组织协同的外部环境也影响着组织协同的适合度，这种外部环境因素包括其他创新系统（特别是创新主体可能参加的其他创新系统）的创新行为，国内外的宏观政治、经济、技术环境因素等。外部环境因素之间产生复杂的作用机制对重大科技工程技术创新系统组织协同行为产生复杂影响，很多情况下，这种影响作用甚至能够彻底改变系统的组织协同状态。因此，研究一个重大科技工程技术创新系统的组织协同适合度，还要考虑与之相关的其他创新系统因素以及外部宏观因素的影响。