一般认为，复杂系统的知识网络包含三个主要因素：知识载体、知识活动和知识资源[65]。知识载体是指系统内的成员、组织、研究单位以及技术中介组织等；知识活动是指组织内各知识载体之间技术和资源等的传播行为，各网络节点内部的知识、学术等资源，可控资源的流动和组织之间的创新互动行为等，以及知识更新、知识创造、知识流动、知识共享等；知识资源则涵盖了用来交流的各类知识和技术，以及保证知识网络正常运行的其他资源要素。系统中的各种知识、知识活动、知识人员等要素的复杂行为形成了系统复杂的知识网络体系。

重大科技工程技术创新系统的知识网络同样具有复杂的系统知识体系结构，它是由核心企业、参与企业、高校、科研院所、政府部门等具有知识的基本行为主体构成，各知识主体间通过知识相互作用并以知识共享、转移及知识创新为目的，主要包括知识源、知识活动、知识要素。重大科技工程技术创新系统知识网络的知识源包括：高等院校及科研机构、政府、核心企业、参与企业以及其他相关机构等，它们之间的知识转移过程分析已如前文所述。在创新系统中，创新任务、管理决策、政策制度、技术等显性知识以及创新人员拥有的经验、技能等隐性知识要素不停地在各知识源间传递、流动、转移，表现出的知识活动包括知识汲取、知识流动、知识共享、知识创造、知识利用等，最终集成创新，形成新的知识。重大科技工程技术创新系统知识网络构成如图3-3所示。

图3-3　重大科技工程技术创新系统知识网络构成(www.daowen.com)

重大科技工程技术创新系统知识网络的运行实质上是在一定的经济、社会、文化等系统外部环境下，系统内的技术、资金、人才、资源等各种要素在各知识活动主体间的有效分配与使用，产生创新知识成果并付诸应用，从而最终影响系统创新发展的过程，在此过程中需要遵循重大科技工程技术创新系统知识网络中的各种运行机制。