除了高校，我国中科院系统的科研院所，重大科技工程技术创新核心企业和参与企业自身拥有的相应科研机构以及其他机构的科研单位在系统中也具有同高校组织相似的作用。这主要表现在这些科研院所具有更为先进的科研平台、专业科研人员和技术资源，更多担负全新技术的研发和试验等任务，源源不断地为系统核心企业和参与企业提供技术支持与创新引领。

根据上述分析，重大科技工程技术创新系统是以产业集群为基本表现形式，以技术创新为手段，以系统国民经济价值最大化为目标，呈现出具有多个子系统的多层次链状创新网络形态，具有明显的复杂网络特征，具体如图3-2所示。

在宏观层面，整个重大科技工程技术创新系统是政府主导的，以主要承担企业为核心，高校和科研院所参与协同创新为其提供技术支持，各创新参与主体自组织形成以创新核心企业为中心的技术产业集群。其组织结构以核心企业为中心，通过对技术流、信息流、知识流、资金流、人才流等的控制，使核心企业协同其他创新主体开展系统的技术创新活动。创新系统连接了政府、核心企业、高校、科研院所、参与企业等多类异质性创新主体，形成具有多层次、多子系统的复杂组织结构模式。在微观层面，产业集群上下游的创新组织之间以技术合作等形式建立复杂的多方合作博弈关系，在创新过程中，创新知识的流动将相关创新参与主体连接起来，进而实现知识经济化过程与创新系统优化目标的功能。在整个创新系统中，引导系统主体运行方向的是以系统综合价值最大化为目标的价值链，包括不同创新主体追求的不同的社会效益、国防效益、生态效益、政治效益、经济效益、技术效益等。(www.daowen.com)

图3-2　重大科技工程技术创新系统的创新网络结构