1979年后，市、郊区各县相继建立林业站，在负责林业技术推广的同时，承担林木病虫害的防治及检疫工作。1985年2月，市林业站增挂上海市林木病虫防治检疫站牌子，同时负责林木病虫害防治检疫工作。1999年，全市有森林植物检疫员55人。该年市林业病虫防治检疫站首次举办全市森林植物检疫员培训班，46名专职检疫员参加森林病虫害专业知识、检疫基础知识、有关行政法规及职业道德教育培训。2000年起，市郊各区县林业站相继增挂林业病虫防治检疫站牌子，内设森防科（检疫科）。由市、区县林业病虫防治检疫站和乡（镇）林业站组成的全市三级森林有害生物防治管理体系基本形成。同时，全市加强林业有害生物监测预警体系建设，构建上海林业有害生物三级测报网络体系，开展林业有害生物防治技术和有害生物计算机管理技术培训，提高植物检疫队伍整体业务水平，一支懂技术精业务的植物检疫队伍逐步形成。2002年，崇明、嘉定、青浦、闵行、松江、宝山6个区县获国家林业局授予的“森林病虫害防治检疫标准站”称号。

2008年，结合上海市“迎世博600天行动计划”，全市林业植物检疫人员增加到118人。同时组建4支市级林业有害生物应急防控队伍，每支队伍配备15人，其中药械操作员10人、药剂调配员3人、综合管理指挥员2人，提升全市林业有害生物应急防控能力。2009年，全市从事森林病虫防治检疫的专兼职人员421人，其中森林病虫防治管理人员50人、专兼职森林病虫测报监测人员207人、专兼职森林植物检疫员164人。其间，市林业病虫防治检疫站加强测报点业务指导，建立周巡视制度，发布病虫信息，开展防治技术培训，全市测报准确率达到83.6％，无公害防治率达到85.6％，无成灾发生，林业有害生物得到有效防控，巩固了林业发展成果，维护了城市生物安全。2010年，市林业病虫防治检疫站选派7名植物检疫专业人员组建世博植物检疫服务团队入驻世博园区，为服务保障上海世博会做出了成绩。(www.daowen.com)

至2010年，全市在林业有害生物防治机构初具规模的基础上，形成以7个国家级中心测报点为龙头、33个市级测报点为骨干和50个区县级监测点为基础的覆盖全市的森林有害生物监测预报网络体系。全市森林病虫防治检疫专职人员有165人，其中高级职称24人、中级职称52人、初级职称41人，中级以上职称占46.1％。