1980年，全市有8家花店。20世纪80年代，随着花卉生产的恢复和发展，上海经营销售花卉的花店、摊贩日益增多。1985年8月，上海市花木公司改制为上海市花木有限公司，经营花卉、苗木、种球、盆景等。1985年、1986年，市林业站花卉基地——市花卉良种试验场、上海花卉联营公司都建立了自己的购销渠道，直接同市区花店和外省市建立供花关系。1986年3月，上海市花卉协会成立，对全市花卉产销和科研发挥协调和促进作用。1987年，梅陇乡花卉经营部也建立自己的购销经营渠道。至此，全市形成4条主要花卉购销经营渠道，既相互竞争，又相互补充。还有不少生产鲜花的个体或集体直接与市区花店签订协议供应鲜花。多渠道的花卉购销经营渠道逐渐取代单一的经营体制。上海在推进花卉基地建设的同时，根据特殊用花、外销、宾馆和外省市的不同用花要求，与10多个单位建立横向联系，为大批鲜花上市多方开拓市场。1990年，全市花店增加至300多家，在江阴路还出现一个花卉贸易市场。当年全市鲜切花上市量1 600万支，其中市内销售量占61.2％，供应全国大中城市占36.5％，出口外销占2.3％。

90年代，上海花卉市场发展迅速。至1995年，全市有曹安花卉市场、永嘉路花卉市场、江阴路花鸟市场等6～7家花卉市场；市花卉良种试验场、虹华园艺公司等大型花卉企业的花卉批发部近10家，专营和兼营的花店1 000多家。1997年11月，由市园林部门创办的上海市苗木花卉交易市场建成营业。2000年，嘉定马陆镇建立苗木花卉交易市场，上海九亭花卉种苗场等4个单位获得农产品自营进出口权。至90年代末，全市有30多家花卉交易市场，其中规模较大的有精文、曹安、古北、曲阳等8家，加之遍布全市的3 000多家花店、花摊，形成了上海花卉销售网络，解决了花农卖花难、花商买花难问题，沟通了产销渠道，搞活和繁荣了花卉市场，促进了花卉业的发展。

进入21世纪后，上海花卉市场快速发展。2000年1月23日，上海大都市鲜花港花卉交易中心建立。国家经贸委副主任陈邦柱、全国商业文化协会会长胡平，市人大常委会副主任任文燕、副市长冯国勤出席揭幕仪式。鲜花港距南京路步行街百步之遥，占地面积5 600平方米，首期开放的建筑面积1.08万平方米，第一批入驻160只摊位。2001年，全市有40多家大小花卉批发交易市场。精文花卉市场成为全市鲜切花交易中心，年销售鲜切花2亿多支，约占全市鲜切花交易量2／3。曹安花卉市场（上海花卉交易中心）营业面积达2万平方米，每天通过新闻媒介向社会发布鲜切花价格信息。松江新桥花卉苗木批发交易市场入户花卉企业50多家，建成433.33公顷花卉生产基地，成为以盆花批发销售为特色的花卉产地批发交易市场。全市鲜切花、盆花零售商店达2 800多家。(www.daowen.com)

2002年6月，市花卉协会花卉市场专业委员会成立，对全市花卉市场进行指导、协调、管理和规范。2003年，全市花卉批发交易市场发展至72家，基本形成大市场、大生产、大流通的新格局。2004年，市农林局提出完善流通体系，规范市场行为，建立和健全花卉市场信息网络体系，形成拍卖市场、批发市场、零售商店等多种功能和不同层次的花卉流通体系。2007年，全市有半数的区县出口花卉，合资花卉生产企业、上海鲜花港、上海种业集团和松江区万亩花卉生产基地等出口额较大。2008年，全市有54家花卉交易市场。

至2010年，全市有56家花卉交易市场，遍布于每个区县，其中20家为经营建筑面积超过5 000平方米的大型花卉交易市场，最大的经营建筑面积逾3万平方米。有8 000多个花卉经营业主进驻各类花卉市场。此外，全市有3 000余家花店，还出现网上订花、鲜花速递、订单交易、花卉租摆等交易方式，满足不同单位和市民的需求，方便单位和市民选购花卉。全市花卉市场体系建设渐趋完善，市场管理不断规范，在连结花卉生产者、经营者和消费者方面发挥桥梁和纽带作用，市场上销售的鲜切花和盆花通过花卉流通体系进入千家万户，上海成为全国最大的花卉消费集散中心之一。