1998年后，保护区随着综合管理水平的不断提高，对外交流与合作能力也不断提升。保护区与湿地国际、世界自然基金会、全球环境基金、国际鹤类基金会、国际野生生物保护学会、美国大自然保护协会、澳大利亚涉禽研究组等国际组织，美国、日本、韩国、马来西亚、新西兰、澳大利亚等国家和地区的专家合作，开展长江口湿地保护、迁徙水鸟及其栖息地保护、鸟类环志、物种再引入科研和环境教育培训等交流活动。

1999年，湿地国际亚太组织将保护区纳入“东亚—澳大利西亚涉禽保护区网络”为成员单位，2002年，湿地公约秘书处将保护区列为国际重要湿地。2003年7月，国家林业局保护司、世界自然基金会、市农林局在保护区实施为期3年的可持续管理项目，开展保护区区徽征集活动，制作1分钟公益广告片、码头灯箱广告、宣传展板等，加强保护区基础设施、东滩湿地专题网站和区域协调机制建设，促进通行证管理制度实施，提升保护区在全球迁徙鸟类资源保育和湿地持续管理方面的能力。

2006年5月24—27日，保护区协助国家林业局国际合作司、保护司在保护区召开中、日、澳、韩、俄五国政府间候鸟保护会议，共同开展跨国迁徙鸟类保护，来自中国、日本、澳大利亚、韩国和俄罗斯的60多位中外代表与会。2008年11月，世界五百强企业3M公司通过大自然保护协会捐资33万美元，用于开展“保护鸟类天堂，营造生态都市”保护区湿地保护项目，同时宣布在保护区设立3M员工志愿者基地。

至2010年，保护区与世界自然基金会、美国大自然保护协会等国际组织合作开展多种形式的环境宣传教育工作，累计出版12种共10多万份宣传保护鸟类、湿地的书籍、简报、图谱和光盘，利用报刊、电视、广播和网站开展鸟类、湿地保护宣传500多次。积极探索市民参与保护工作，建立环境教育中心和志愿者之家，推动保护区志愿者队伍建设和环境教育工作。

表6-1　崇明东滩鸟类自然保护区国际交流合作项目情况表

说明：资料来源于上海市崇明东滩鸟类自然保护区管理处。

附录：领导视察

2004年10月22日　全国政协副主席李贵鲜视察保护区。

2005年5月26日　国家环保总局副局长祝光耀对保护区进行考察。

2005年8月19日　国家科技部部长徐冠华考察崇明东滩国际重要湿地。(www.daowen.com)

2007年4月12日　中共中央政治局委员、上海市委书记习近平，市长韩正在崇明工作调研期间视察保护区。

2008年1月22日　中共中央政治局委员、上海市委书记俞正声视察保护区。

2009年4月21日　国家林业局副局长印红到崇明东滩视察指导工作。

2009年5月19日　原国家副主席、中共中央政治局常委、中央书记处书记、中央党校校长曾庆红视察保护区。

2009年10月31日　市长韩正、副市长唐登杰以及第21次上海市市长国际企业家咨询会议成员等100余人齐聚保护区参加鸟类环志户外活动，并放飞黑腹滨鹬。

2009年11月2日　全国政协副主席陈宗兴视察保护区。

2010年1月22日　中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林在中共中央政治局委员、中共上海市委书记俞正声和市政协主席冯国勤等陪同下视察保护区。

2010年9月26日　全国政协常委、副秘书长，中国国民党革命委员会副主席修福金视察保护区。