2006年起，市林业局每年委托华东师范大学河口海岸科学研究院国家重点实验室采用3S技术开展全市湿地资源变化情况监测，编制上海市湿地资源监测年度报告和提交相关数据资料，湿地资源监测趋于常态化和数字化。2007—2010年，根据1990年、2000年、2005年、2006年、2007年和2009年上海市遥感影像，以及1990年、2000年和2006年数字化海图，开展5公顷以上内陆湿地和近海及海岸湿地的遥感影像解译和野外查验工作。2007年遥感影像解译显示：全市5公顷以上湿地共有34.9万公顷，其中内陆湿地总面积9.42万公顷，近海及海岸湿地25.48万公顷；100公顷以上湿地26.82万公顷，5～100公顷湿地8.08万公顷。2009年遥感影像解译显示：全市5公顷以上湿地共有34.26万公顷，其中内陆湿地总面积8.61万公顷，近海及海岸湿地25.65万公顷；100公顷以上湿地27.37万公顷，5～100公顷湿地6.89万公顷。与1990年湿地调查数据相比，湿地总面积减少7.46万公顷，生物多样性方面呈现逐渐恢复的良好态势。

2008年12月，崇明东滩保护区管理处编制出版《2006—2007年上海市崇明东滩鸟类国家级自然保护区年度资源监测报告》，根据对保护区潮滩地貌演变、植被资源、底栖动物资源、浮游动物资源、鸟类资源、潮间带鱼类资源和潮沟水质的调查监测结果，对保护区的资源状况进行综合分析与评价。此后，每年编制和公布《上海市崇明东滩鸟类国家级自然保护区年度资源监测公报》。

2009年10月30日—11月3日，受国家林业局委托，国家林业局规划院评估组到上海对长江口中华鲟保护区、崇明东滩保护区等两处国际重要湿地生态现状开展考察和评价，专项监测内容有崇明东滩潮间带植被、潮间带大型底栖动物和水鸟、中华鲟种群数量等10余项。此前，根据《国家重要湿地生态评价办法（试行）》中的评价指标及赋分表，两个保护区进行自我预评并提出自评报告。评估组经过对自评报告中数据来源的审查和保护区现场踏勘，认可两个保护区的自评报告及评价结论。长江口中华鲟保护区属于濒危物种保护类型国际重要湿地，考察2个指标，自评得分为90分，总体评价等级为优；崇明东滩保护区属于滨海与海岸类型国际重要湿地，考察7个指标，自评得分为91分，由于保护区内互花米草分布区域面积为15.68平方千米，占全部湿地植被面积42.78平方千米的36.65％，入侵物种面积占全部植被面积的比率≥20％，该指标等级为差，因此总体评价等级为中。(www.daowen.com)

表4-2　1990—2009年上海市内陆湿地和近海及海岸湿地面积统计表

说明：资料来源于《上海市湿地资源调查与监测评估体系研究报告》。