在间接独立保函下，申请人要求其国内银行（称为指示行）向受益人所在国（地）的银行（称为保证人）发出开立保函的指示。因此，在间接独立保函中，其相关人为保证人、受益人、申请人和指示行。

在间接独立保函中，有两个不同的委托合同，即申请人与指示行之间的委托合同、指示行与保证人之间的委托合同。如同直接独立保函一样，保证人以自己的名义向受益人承担保函义务，接受指示行委托办事。为了免于向受益人付款后遭受损失，保证人一般要求指示行提供反保函，一旦受益人向保证人提出索款要求，保证人履行付款义务后，他有权依反保函向指示行要求赔偿，而指示行在向保证人赔偿之后，再向申请人要求偿付。但指示行与受益人之间没有合同关系，因此，受益人不能直接向指示行提出索款要求。(www.daowen.com)

与直接独立保函相比较，间接独立保函关系中多出一个指示行与保证人之间的关系，而且他们分别处于不同国家，从而导致间接独立保函的关系更加复杂。保证人向受益人提供的保函通常称为“基础保函”（Primary Guarantee），以区别于指示行提供的反保函。在间接独立保函中，多数情况下各相关人是相互独立的，但在有些情况下，这些相关人又是相互关联的。申请人与受益人的主要权利与义务与前述基本相同，不再赘述。这里仅对指示行与保证人的主要义务进行分析。[9]