本文理论部分的假说认为，技术创新与市场结构之间存在交互机制，也即双向因果关系，这也符合演化经济学分析中对“累积因果”的认识。在解决市场结构和创新之间双向因果关系通常的做法是选择合适的IV，用两阶段法来控制因变量对自变量的反向影响，但工具变量法合适IV难以寻找以及无法判断其中影响方向和大小，所以本文构建联立方程组来分析市场结构和创新两者的双向因果关系，具体形式如下：

该联立方程组包括两个方程，技术创新绩效方程和代表市场结构的市场集中度方程。

（1）技术创新绩效方程。该方程的解释变量为市场集中度的近似赫芬达尔指数SHHI，被解释变量是技术创新绩效，用新产品销售收入占行业总收入的比值表示。其他四项是控制变量，ZL是发明专利申请数，表示技术创新活动的中间产出，BD是小企业产值占比，表示行业进入壁垒，进入壁垒与行业竞争压力有一定关系，RDK是行业研发投入内部支出与行业产值的比值，代表创新的资本投入，RDL是科研人员全时当量，代表创新的劳动投入，二者与技术创新绩效应有正向关系。我们预期市场集中度增加表示行业竞争压力减小，由此行业的技术创新绩效会下降，所以市场集中度对技术创新绩效的影响是负的。(www.daowen.com)

（2）市场集中度方程。该方程的解释变量为技术创新绩效INNOV，具体指标为新产品销售收入占行业总收入比重，进入壁垒BD，企业规模ASIZE是控制变量，因为市场集中度除了受技术创新结果的影响，可能还会受到行业进入壁垒影响和企业平均规模的影响，平均规模大的行业其市场集中度变化的可能会慢一些，因为行业内大企业的生存能力普遍要好于小企业，当经济下滑时，受到冲击的首先是小企业。在研究技术创新绩效对市场集中度的影响时，必须要将这些影响因素作为控制变量纳入方程。本文在理论部分的分析认为，如果行业内技术创新与市场结构之间存在良性交互机制，则行业整体技术创新绩效的提高会导致竞争的加剧，即技术创新绩效对市场集中度的影响是负的。如果两者之间不存在恶性交互机制，则可能不存在这种作用关系。