投入结构问题主要指要素投入结构不平衡，投入效率不高。

第一，供给侧要素投入结构不平衡，从而导致经济增长方式粗放。从供给侧来看，由于中国经济发展过度依赖土地、劳动力、资源等一般性生产要素，一般性生产要素投入比重过高，而技术、人才、知识、信息等高端要素投入不足，导致中低端产业比重偏大，高技术、高质量、高附加值产业少，人才少，资源能源消耗过多，环境恶化等问题。随着工业化、城镇化进程的不断加快，企业在经营过程中将面临土地、劳动力、原材料等要素成本的不断上升，而消费者对产品质量的要求越来越高，国际市场竞争日益激烈，中国经济增长将面临总量较快增长和结构加快转型的双重要求。从经济发展的国内条件和国际环境看，前30多年中国经济高速增长得益于资源红利、人口红利和改革红利在改革开放中的全面持续释放，而随着资源耗竭、人口老龄化和改革的停滞不前，原有的经济增长方式将难以为继，国际竞争和国际合作又提出了全方位、高层次的要求。为此，需要进行供给侧结构性改革，加快推进科技体制、教育人才体制等改革，优化要素投入结构，加快转变经济增长方式，培养更多高端创新人才，实现创新驱动。(www.daowen.com)

第二，投入效率不高。就劳动生产率而言，虽然20年以来中国的劳动生产率大幅提高，年平均增速为8.6%，但2015年中国每个就业者创造的GDP为7318美元，仅为世界平均水平的40%，美国的7.4%，但这也反映出中国经济未来增长潜力较大，就投资效率而言，中国的固定资产投资效率总体上是动态有效的，但近年来资本产出比呈现出逐渐下降的趋势，资金高投入、低效益、低水平运作问题仍然存在。