知识产权保护的好坏，直接关系着社会产业创新能力的高低，一个好的产业发展链条，必然是建立在对该产业知识产权保护的基础之上。恩施富硒产业经过了20多年的发展，在知识产权保护领域仍然有所欠缺。例如对企业富硒产品商标的保护力度不够，地方保护主义严重，缺乏统一部署，对外又缺少统一步伐，同时对于本地区很多优秀的富含硒文化的非物质文化遗产的保护及开发力度也不强。

前段时间闹得沸沸扬扬的“龙船调”商标事件，实质上就是知识产权之争，地方政府在这一事件中与企业就“龙船调”商标归属问题相互之间各执己词，并且在主流媒体上大肆攻伐，既让外界看了笑话，同时也是对本地区民族品牌的一种伤害。而在这一过程中，更多地应该看到对于富硒产品知识产权的保护意识尚待加强。(www.daowen.com)

科学技术是第一生产力，企业能否发展得好，能否走得更长远，科研能力是重中之重。当下，在传统行业市场竞争激烈，利润微薄的情况下，企业科研能力更是关系着企业的生死存亡。科研创新既是社会也是企业发展的不竭动力，在恩施州富硒产业的整体发展上，很明显可以看出，企业在科研创新领域出现了较为明显的短板，产品单一，附加值低，大多仍然是以原材料的方式出售，农户及当地企业的利润受到外界因素影响较大，农户大多只是获得了一点“工钱”，而企业大多只是获得了一点“加工费”，真正的高附加值的富硒产品往往被外来的市场主体获得，这无疑是对恩施硒资源产业的一种透支。