1.农民思想观念较为保守，对电子商务认识不足。由于我国农村生活水平较为落后，农民的思想观念保守，因而使得广大农民接受新鲜事物存在一定的难度，发展农村电子商务也成为一项全新的挑战。而农民文化水平普遍不高，再加上思想封闭，因而并不十分认可电子商务。除此之外，针对农村电子商务业务开展相应服务的单位及组织也比较少，难以向广大农民群众及时传播先进的农业科学信息及市场信息。作为一项新型的在线支付交易方式，电子商务买卖双方无须见面交谈，只通过网络便进行交易，因而采购商可能毁约，存在一定的风险性。再加上农民每年的收入十分有限，难以承担风险导致的经济损失，小农意识强烈，十分惧怕风险，因而不敢去尝试电子商务这一新型的交易方式。除此之外，电子商务交易不安全性比较高，风险大，农民因而对其存有怀疑乃至排斥的态度，使得电子商务在农村的运作与发展受到了较为严重的阻碍。

2.信息化基础设施落后，缺乏必要的网络知识。现阶段，我国大部分农村的信息化基础设施落后，电脑普及程度依然不高，即便拥有电脑，也仅仅只是用于上网聊天或玩游戏等。在一些偏远的贫困山区，甚至都未能普及电话，这给农村电子商务的建立及发展带来了非常大的困难。若要开展电子商务活动，具备一套起着农业传播信息的网络设施是必不可少的。然而目前，我国缺乏致力于农业信息化建设的专业人才，并且农民对电子商务及信息技术等相关知识的了解比较少，极大程度上降低了农民对农村电子商务建设及发展的主观积极性。

3.缺乏健全的物流体系。一方面我国农村地域及人口分布广泛且偏僻，导致了农村的交通运输落后，物流技术难度大等问题。大部分物流公司的配送范围未能延伸至乡镇地区，一些比较偏远的农村地区更是在物流配送范围以外；另一方面农产品有着易腐烂、易变化、季节性强等特点，在物流过程中需要高质量的运输设备。由于缺乏健全的物流体系，一些农村电子商务的需求难以得到充分满足，在许多农村地区依然存在运输难这一不容忽视的问题。由于缺乏专用的农业运输技术设备，现有的技术装备比较落后，鲜活的产品极易发生腐坏，再加上农村交通不发达，配送点分散等，直接影响了农村电子商务的发展。

4.农村电子商务的生产规模有待加强。我国农村土地当前以承包或农民个体生产为主，土地的零散导致农作物生产规模比较小，农民个体难以提供充足的农产品，进而不具备强有力的市场竞争力，难以产生规模效应。此外，在运输农产品的过程中，还需确保产品的新鲜，不但交易的成本偏高，且买卖过程缺乏有效的透明度。由于指导农民学习农业信息等活动比较少，小规模的农业组织及农民个体的市场信息收集与分析能力不高，不利于农村电子商务业务的发展。(www.daowen.com)

5.农村电子商务发展缺乏社会的关注度和重视度。虽然国家和相关部门积极推广农村电子商务，但个别地方政府部门没有深刻认识电子商务的重要性和发展的紧迫性、必要性，没有采取更有力的措施来发展农村电子商务。而且农村电子商务存在前期建设成本大，回收慢的特点，一些企业认识不足，只追求短期利益而延误了农村电子商务的建设，另外相关媒体对农村电子商务发展和交易方面的宣传力度不足，这一系列的因素都直接制约了农村电子商务的发展。

6.农村电子商务人才缺乏。农村电子商务要求既懂互联网技术又精通农产品市场营销的复合型、应用型及创新型人才。目前，因为农村各方面条件的限制，此类人才短缺，严重制约了农村电子商务的快速发展。