在次区域层面，非洲国家也根据共同的发展诉求，积极探索区域经济一体化，其中最具代表性的次区域组织包括：

阿拉伯马格里布联盟（UMA），成员国为摩洛哥、阿尔及利亚、突尼斯、利比亚和毛里塔尼亚等5个国家。该联盟旨在协调各方经济和社会方面的立场、观点和政策等，推动成员国经济的互补合作，促进该地区的经济一体化发展。该联盟组织机构的最大特色为设立了多个委员会，这有助于决策过程中充分听取各方的意见，增强决策的合理性和科学化水平，从而有助于制定高效的经济一体化建设政策。

东非共同体（EAC），成员国为肯尼亚、乌干达、坦桑尼亚、布隆迪、卢旺达和南苏丹6个国家。该组织旨在加强成员国在经济、科技、外交等领域的合作，协调成员国的发展战略，促进成员国经济的可持续发展，建立促进经济发展的关税同盟、共同市场、货币联盟等。东非共同体的首脑会议历来强调经济一体化的发展，如2018年第十九届首脑会议的主题为“促进经济社会发展，推进一体化进程”；2019年第二十届首脑会议的主题为“加强东共体经济、社会和政治一体化”。^[4]

西非国家经济共同体（ECOWAS），由尼日利亚、贝宁、布基纳法索、佛得角、冈比亚等15个国家组成，该组织旨在促进成员国政治、经济、社会等层面的合作，加强经济联系水平，增强西非地区的经济一体化水平。该组织机制化建设发展迅速，2003年就已建成西共体投资和开发银行，银行负责制定区域投资政策，向西共体成员国项目建设提供资金，促进各国的经济发展。“为了促进非洲一体化的进程，西非经济共同体的各成员国领导人接受从2020年起将‘埃科’作为该地区的单一货币。”^[5]

南部非洲发展共同体（SADC），由南非、安哥拉、纳米比亚、坦桑尼亚等16国组成，该组织旨在建设开放型的经济，促进成员国间的贸易投资，逐步统一关税和货币，最终实现经济一体化。该组织为南部非洲最为活跃的次区域组织，南共体不仅积极推进地区的经济一体化建设，还积极推进与其他组织的经济关系。如2015年6月南共体同东共体、东南亚共同市场正式启动三方自贸区建设；2016年6月，南共体成员国与欧盟签署了经济伙伴协议。^[6]协议中明确指出“欧盟将保证博茨瓦纳、莱索托、莫桑比克、纳米比亚和斯威士兰的全部进口商品免税。欧盟也将全部或部分取消98.7%南非产品的关税”。^[7](www.daowen.com)

萨赫勒-撒哈拉国家共同体（CENSAD），由利比亚、苏丹、尼日利亚、加纳等29个国家组成，该组织旨在加强成员国的政治经济合作，促进地区的经济一体化水平。该共同体的发展目标是建立一个全面的经济联盟，促进资本的自由流动，保证各成员国的经济活动自由，改善成员国的交通运输网络。该共同体的下设各机构经常举行会议，加强彼此间的政策协调，从而有助于推进经济建设各领域的协调发展，推进经济一体化建设水平。

东部和南部非洲共同市场（COMESA），由布隆迪、埃及、肯尼亚、津巴布韦等21个国家组成，旨在实现成员国商品和劳务的自由流通，协调成员国的关税政策，协调各国的经济结构。该组织是非洲成立最早、规模最大的经济合作组织，也是全球第四大区域经济组织。该共同体有着非常明确的发展目标，即逐步实现贸易、关税、投资、财政的一体化，达到地区间高度的融合，其将在2020年实现货币单一化，这将极大地促进该地区经济的融合。

中部非洲国家经济共同体（ECCAS），由安哥拉、中非、卢旺达、喀麦隆等11个国家组成。该组织旨在协调成员国的经济和社会活动，促进人员、财务、资金等的自由流动，通过设立基金促进欠发达国家的发展。由于地区冲突等不稳定因素，中非国家经济体在建立之初不够活跃。在1999年被确立为非洲经济共同体八大支柱之一后，该共同体的发展提速，积极推动该地区的经济平衡发展、增强地区成员国的经济发展活力。

非洲次区域层面经济一体化组织的建立有助于促进本地区经济一体化水平的发展。由于非洲每个地区的发展状况不同，在经济一体化建设过程中很难做到同步，而次区域经济一体化组织的建立则有助于解决这一问题。相邻国家因共同的历史、资源禀赋等原因易于在经济发展中进行合作，可以做到次区域的同步。同时，次区域层面的国家因地缘等因素更容易在经济政策方面进行协调，从而有助于一体化的发展。此外，各次区域经济组织的发展各有特色，彼此借鉴经验，也有助于加速非洲整体经济一体化的进程。