水能资源的开发改变了河流原有的天然流动属性，不可避免地会带来一些生态环境的问题。

1.对河流生态的影响

在河流上修建大坝之后，连续河道变成了分段型河道，天然河流的流量、流速、水位等流态因而发生明显变化，天然河道的泥沙运动规律也因此被打破，进而引发整条河流上、下游及河口的水文特征发生显著变化。

2.淹没的影响

工程建库蓄水除了会淹没一定数量的原有植被，导致一些珍稀动植物消失外，更为重要的是水电工程都有不同程度的水库淹没，需进行一定数量规模的移民安置。我国人口多，土地资源少，水库蓄水将淹没库区的原有农田，特别是对于水能资源较好、土地资源较为匮乏的山区，移民安置与解决耕地问题的矛盾十分突出。

3.水库诱发灾害(www.daowen.com)

修建水库或引水、发电工程将造成原有河道的局部断流，会给下游居民的生活上带来一定困难；而对多泥沙的河流，泥沙受到水库的拦蓄，时刻威胁大坝的安全。对大的水电工程，大坝积蓄的库水也将会给下游带来一定影响，特别是大坝的安全至关重要。

大坝建成蓄水后，所形成的库区水文地质环境发生一定变化，可能因蓄水引起地震、滑坡、崩岸等地质灾害问题。

4.施工影响

水电工程一般施工规模较大，施工周期较长，施工人数和施工机械较多。在施工过程中涉及大量的边坡开挖、施工导流、取土弃渣、料场开采等活动，改变了原有的自然地形、地貌，如处理不当会导致岸坡水土流失、引发泥石流等灾害。