1.关税存在的问题

内资和外资清洁能源企业之间存在的市场竞争有时是不公平的，如在进口高端清洁能源设备时，由于内资和外资企业在中国的免税政策不同，外资企业能享受一些关税优惠政策，而内资企业却不可以享受优惠，这种不公平显然会使本来就艰难的内资企业在清洁能源行业的竞争力下降，而且加大了资金周转的压力。同时，关税优惠广度不够，优惠范围较小，只是给予了一些限定的清洁能源设备关税的优惠政策，如太阳能电池和风力发电机具有政策优惠，而其他一些项目却很少享受优惠。

2.增值税存在的问题

在生产与流通环节缴纳增值税是普通企业普遍面临的，增值税的征收对我国清洁能源产业有着不可小觑的影响。但增值税征收方面也有一些不足，对于总体的清洁能源来说，并未达成统一，没有享受到同样的优惠政策，而只是为清洁能源中的很小一部分规定了单独的优惠税率，所以增值税优惠政策虽然具有一些作用，但总体来说完整性和系统性不够，比较片面。问题在于：一些清洁能源项目已享受过增值税优惠政策，但依然有着较高的税率，像风电项目，享受优惠之后仍然有着高达8.5%的税率。

3.企业所得税存在的问题(www.daowen.com)

我国企业所得税与增值税一样，也缺少一个完整统一的优惠政策体系，只有部分地方政府在当地环境基础上颁布了一些地方的优惠措施。如广东省规定风力发电的相关企业按照15%的比例减征增值税，此举有力地推动了风电行业的发展；内蒙古自治区则颁布了风电企业可免征2年企业所得税的优惠政策。《国家当前重点鼓励发展的产品、产业和技术目录》也有针对清洁能源企业的优惠政策：对一些符合要求的国有投资企业，投资额可以抵免部分或全部所得税、加速折旧等。投资抵免的过程比较简单易行，但许多企业经常放弃加速折旧优惠政策，原因是该政策加大了企业的短期成本，使当期的利润降低，或者折旧的值比利润高，就会使其他年度的减免和扣除受到影响。另有一个就是优惠政策受用面不够广的问题，因为一些优惠政策是专为高新技术企业制定的。总而言之，主要的问题在于政府扶持力度不够，各地优惠措施不统一，且缺少系统完整的措施。在细节上，没有根据清洁能源企业的具体情况来制定更详细的优惠政策。这是因为在早些年清洁能源企业盈利很难，实施一年减免、减收一半的政策难以让风电企业感受到实在的优惠。

4.其他税种存在的问题

一些地方税种如土地增值税、城镇的土地使用税、耕地占用税和房产税可以对清洁能源的利用和发展起到有力的促进作用，而且这些税种在计征过程中能够区分投资主体和消费主体。但地方税在扶持清洁能源产业发展过程中的贡献还有待进一步提高。我国仅少部分地区在清洁能源项目占用土地方面给予了企业减免土地使用税收的优惠。因此有必要发挥地方税种在降低清洁能源运营成本、优化当地能源消费结构等方面的作用。