巴西出口货物的90%以上是经由巴西水路运输通往世界各地的。因此，水路运输得到巴西政府的高度重视。一方面加强水运立法，将水运管理纳入法制化轨道；另一方面设立专职的全国水运管理部门，加强规划和水运基础设施的建设。

1.巴西航运管理法规。巴西目前没有专门的航道管理法规，但制定有《巴西水运法》，该法于1997年由巴西国会制定并实施。还有国会于2001年6月5日通过了10233号法令，根据此法令，建立了全国交通政策委员会，陆路、水运运输及交通基础设施建设管理机构，以及相应的职责。虽没有专门的航道法，但以上法律（令）都包含有关于航道管理的相关内容。根据以上两部法（令）及其他有关法律，巴西成立了较为完备的水运管理机构，如巴西水运管理局、巴西港务总局、巴西交通基本建设局等，还有海军也履行部分水运管理职责。包括水运在内的交通基础设施建设由巴西交通基本建设管理局负责，该局除了承担建设职责，还对航道及航道设施等交通基础设施担负有管理和保护职责，对破坏这些设施的行为可以依法处罚，对各种跨、临、拦河建筑物的通航标准审批职能也是由它来承担；巴西水运管理局主要负责运输管理与服务；港务总局负责对港口实施政府管理职能；巴西海军的水运管理职能主要对水上安全、污染、海员等进行管理；船闸通航管理由发电企业自身负责。

2.巴西航运管理机构。巴西是联邦制国家，由于巴西河流众多，很多河流穿越好几个州，联邦政府对水运事业的管理和协调非常重视。在国家一级的政府机构中，除了设有交通部之外，还专门设有国家水运管理局，并列在巴西国家航天局、巴西国家电力局、巴西国家石油局等重要的国家机关之中。巴西国家水运管理局是根据国会于2001年6月5日通过的10233号法令设立的。按照这个法令，巴西国家水运管理局设于首都，是独立的法人机构，虽然与交通部有工作联系，但具备特有的自主权、独立的管理权、对重要河流设立地区性管理局和任命其领导人的人事权。国家水运管理局的最高决策机构由一个局长、两个副局长和各司司长组成。局内设有办公厅、海运司、河运司、宣传司、国际司、技术司、监察司等。由于巴西海岸线长、海运事业发达，内河航运又在穿越几个州的辽阔流域中进行，很多工作（特别是立法）牵涉到各州和各方面的利益，所以在国家水运管理局内部还特别设立了国会协调司，与巴西参议院和众议院加强联系和沟通。另外，巴西的大河大江大多距离首都遥远，所以国家水运管理局针对这种情况，结合对重要海运港口的管理，还设立了马瑙斯（亚马孙河）地区管理局、佛罗利亚诺玻利斯（东南部）地区管理局、贝伦（北部）地区管理局、累西菲（东北部）地区管理局和里约热内卢（海运）地区管理局。(www.daowen.com)

巴西国家水运管理局的职能是：（1）按照巴西全国交通政策一体化委员会的指导意图，在自己职权范围内，制定相关的水运管理政策法规。（2）管理、监督、审计水运部门的工作和服务，规划和开发港口和水路的基础设施建设，确保旅客和货物的正常运输。协调各区域水运管理部门和各企业的利益。（3）仲裁各类利益冲突，阻止不规范的无序竞争，维护经济活动的正常进行。