虽然广东省民营科技企业的管理制度已经逐步健全，但是不少民营科技企业在人员激励、管理手段以及企业文化建设等方面仍存在很大问题。

（1）人力资源管理体系初步建立，激励机制尚需加强。民营科技企业把发展科技产业作为自己的目标，把科技人员作为主体，并且认为建立在智力和知识的基础之上是它最基本的特征，因此，民营科技企业在整个成长过程中对人才资源有很高的要求。同时，人才资源对所在企业的激励机制以及制度也会有一定的期望和要求。目前广东省民营科技企业的激励机制还存在不足之处，例如对人才培养重视程度不够、激励程度难以调动员工积极性、考核不合理等。这些不足是根据以往的经验与调研得出的。

（2）管理制度基本建立，管理水平有待提高。虽然广东省大多数民营科技企业通过完善财务、营销、人力资源、科技开发等部门，使得其管理制度基本建立，但是民营科技企业仍存在着家族企业的阴影，无疑大大限制了企业的发展。(www.daowen.com)

（3）虽然企业足够重视企业文化建设的重要性，但实际行动却很缓慢。企业文化，或称公司文化，一般是指企业在长期的实践活动中所形成的，并且为本组织成员普遍认可和遵循的，具有本组织特色的价值观念、团体意识、工作作风、行为规范、思维方式的总和。企业文化对组织成员有感召力和向心力，具有整合性，也即企业文化具有把众多人的兴趣、目的、需要以及由此产生的行为统一起来的功能，它是企业长期文化建设的缩影，代表着组织的记忆。因此，可以说企业文化对于一个企业的成长所起到的作用是举足轻重的。虽然广东省民营科技企业意识到企业文化建设的重要性，但是它们的管理者并未发觉企业文化建设的紧迫性。