在对合作型劳动关系的研究中，部分学者认为工会是造成集体谈判中劳资关系对立、劳资冲突层出不穷的根源，而合作型劳动关系强调雇主和雇员利益具有一致性，双方可以通过建立充分的沟通与信任关系化解不协调行为，工会的存在只会加剧劳资矛盾，因而工会没有存在的必要性。这个观点的提出与西方国家工会本身的职能有关，而西方国家工会的职能是在特定的政治和经济制度下形成并发挥作用的，与我国工会所处的运行环境存在较大差异。在中国现阶段特定的环境下组建的工会不会形成与雇主完全对抗的力量，这一特殊性是当前构建合作型劳动关系中工会特有的优势。

我国科技型中小企业规模相对较小，迄今为止，部分企业还没有建立工会组织。工会的缺位导致雇员和雇主不能在相互对等的平台上展开对话，雇佣双方合作所需的制衡关系难以形成。由于多数企业规模较小，单纯依靠一个企业建立工会组织往往因势单力薄而力不从心。对此，企业员工可以依托所在园区建立工会组织，或者根据不同产业组建行业工会组织。关于工会的组建方式，理论上以自愿方式最为合理，地方工会给予必要的协助和指导。但是考虑到我国科技型中小企业雇员分散，力量相对薄弱，而我国工会是在党政主导模式下运行的，因此，工会的组建可以运用这一优势，以行政促建手段为主，采取自上而下的方式进行组建，扩大科技型中小企业工会的覆盖面。(www.daowen.com)

为了发挥工会在构建合作型劳动关系中的作用，首先要让工会的权威和地位得到树立，使工会能够真实反映雇员的意图，让员工的声音能够通过工会得到准确表达。在同管理层的互动过程以及集体谈判中，工会应该独立于企业管理，通过增强工会的独立性，提高工会在雇佣双方对话和谈判中的地位。工会负责人和员工代表可以通过参加培训等方式学习企业经营管理和人力资源管理等方面的知识和技能，提高其在参与企业治理中的战略决策能力，真正与企业管理层建立起战略合作伙伴关系，从企业战略层面上推动合作型劳动关系的建立。