从企业绩效评价的角度来看，杜邦财务分析体系仅包括财务方面的信息，不能全面反映企业的实力，因此有很大的局限性，主要体现在以下六个方面。

(1)杜邦财务分析体系没有包含资产成本这一重要因素。倘若企业在经营过程中仅仅以净利润作为衡量股东财富的标准，而忽视资产成本的存在，就会导致企业为追求短期利润而盲目投资，给企业的长期发展带来不利影响。

(2)净资产收益率指标单一。单纯用净资产收益率这一指标来反映企业经营者的运营能力，往往会导致经营者为追求企业的高利润、社会的高评价，而做出错误的投资决策，使企业在净资产收益率增长的情况下其实际利益却受到损害。

(3)无法有效满足企业加强内部管理的需要。一方面，杜邦分析法主要是利用净资产收益率、总资产收益率、权益乘数等主要财务指标间的关系综合分析企业的财务状况。这些资料主要来源于企业过去的财务报表，实际上是利用过去的财务资料对企业过去的财务状况进行分析。另一方面，该方法所用的资料主要源于财务报表，未能充分利用成本分析数据、风险分析数据等管理会计的资料，不利于企业加强内部控制。(www.daowen.com)

(4)未能反映企业的经营风险及财务风险。在当前市场竞争越来越激烈的情况下，风险分析更加需要引起重视。

(5)不能反映上市公司的经济技术指标，如股东权益、每股净资产、合并利润表中的“少数股东本期收益”项目等。在现有杜邦财务分析体系中，以净资产收益率为核心指标存在一些问题，它不完全符合上市公司股东财富最大化的要求。股东财富最大化是对企业未来价值的认可，考虑了时间价值和风险因素，而净资产收益率是权责发生制下的财务报表的反映，不能完全衡量股东价值。

(6)现有杜邦财务分析体系所采用的数据都来自资产负债表、利润表、所有者权益变动表，没有反映企业的现金流量。在实际中，现金流量对于一个企业的经营活动是否顺畅至关重要，现金流量信息是财务分析者对企业的财务状况做出准确判断的重要依据。