与其他行业一样，港口上市公司利用资本、劳动来为港口提供服务。因此，其投入的是资本和劳动。不同的港口企业，其投入资本的形态并不相同，有些是港口设施，有些是运输工具，有些是仓库。因此需要用一些统一的指标来反映不同港口企业所投入的不同资本。使用一些方法对港口成本效率进行评价，需要选择能反映总体执行力的综合指标。在进行输入、输出指标选择时，最重要的是选择能反映港口物流供应链功能水平并满足港口上市公司成本效率评价要求的指标，同时还需考虑数据的可获得性，并确保输入、输出指标个数之和要小于DMU的数量。本书拟定以下输入指标：

（1）总资产，反映资本总体投入量。对于港口上市公司来说，资产是一项重要的投入，包括房屋、码头、运输工具、仓库等固定资产的投入。资产总值的规模不但是一个港口企业规模大小的标尺，而且直接影响其运作效率，是港口上市公司的一项重要指标。一般而言，发展较好、效率较高及港口物流供应链能力较强的公司，其资产越能够保持稳定增长[77]。

（2）职工数量，是指在职员工的数量，不包含离退休人员，其能够反映公司劳动的输入量，是公司输入中最为活跃的要素，也是公司发展的动力源泉。职工数量投入多少在一定程度上能够体现港口上市公司的成本，是其成本中比较重要的输入指标。

（3）主营业务成本，体现了港口上市公司为取得业务收入而耗费的资源价值，是经营过程中需要直接输入的资源。既定的公司净利润，其主营业务成本越低，表明该港口企业运作效率越高。因此，主营业务成本作为港口上市公司的一项投入记为模型的输入变量之一。(www.daowen.com)

从输入层面讲，总资产、职工数量和主营业务成本这三个输入指标是从“资本”“劳动”和“资金”三个角度来衡量港口上市公司的输入成本，很大程度上反映了其核心业务的主要输入成本，能够反映港口上市公司的真实情况[78]。

从输出层面讲，陈军飞等（2004）使用数据包络分析模型对15家港口水运上市公司运营相对效率进行评价分析的基础上，借鉴使用主营业务收入、净利润作为港口上市公司的输出指标。在现代公司经营体制下，这两个指标能较好地衡量港口上市公司的经济效益及产出有效性[79]。