土地信息系统的功能结构包括下列五大部分。

1. 输入子系统

这部分接受外来各种数据，包括遥感影像数据、专业图件数据、测绘调查数据、文档资料数据以及各数据库数据及网上数据。输入操作的便捷性、保证各种数据的协调一致性以及生成数据的规范性是系统对这一部分的基本要求。通常这部分工作方式包括有手扶数字化仪采点图件输入;扫描仪扫描图形、图像录入;属性、文档数据键盘录入;网上数据下载录入等。

2. 数据库管理子系统

这部分是系统工作的基础。空间定位数据与属性数据一体化管理是系统对这一部分基本要求，保证数据的质量，加大数据的安全性，减少数据的冗余度，提高数据运行的效率是这一部分设计的目标。由于数据本身的重要性，这一部分在系统中有一定的独立性，高质量的数据库管理系统建立起来的土地信息数据库应当是跨软件平台的，即多个软件平台可以共享一个数据库。

3. 系统管理子系统(www.daowen.com)

这部分是系统工作的指挥协调部，也是系统对外的窗口。系统与用户的界面即通常所说的工作菜单、各模块的连接、用户帮助、使用提示等都是由这部分来实现的。这一部分的程序设计在WINDOWS操作系统环境下使用高级语言并不困难，关键是做好系统分析，将系统中各模块的划分与连接关系设计合理。

4. 专家子系统

这部分包括系统中的所有应用模型与相应的功能模块。它在系统管理子系统支持下，调用数据库中的数据，按照模型的要求进行各种运算分析，最后得到结果，交付输出子系统输出。如果说其他各部分都可以由地理信息系统软件平台、数据库管理系统软件提供基本的功能，那么这部分则需要系统开发设计人员与土地管理专业人员一起独立地根据土地管理的要求进行程序设计。这一子系统的设计与开发的质量取决于对土地管理准确而深刻的理解以及计算机信息技术的运用。

5. 输出子系统

系统所有工作结果都由这一部分向外发布。输出的方式包括屏幕显示、打印机打印、绘图仪制图、数据拷贝、通过动态网页数据上网等。图件、表格输出前的编辑、整饰也要依靠这一部分软件的支持通过人-机交互的方式实现。用户界面友好、提供功能齐全以及图件表格制作规范美观是系统对这一部分的要求。