我国人均水资源较少，不少农村由于水污染而造成水质性缺水，加剧了我国水资源短缺的困境。农村水环境主要分布在广大农村的湖泊、池塘、河流、水库以及地下水等。在地表水国家控制监测断面中，Ⅳ类～Ⅴ类和劣Ⅴ类水质的断面比例已经上升到了24.3%和18.4%。26个国控重点湖泊（水库）中，劣Ⅴ类水质有9个，占了总体的34.6%。其中，只有6个满足Ⅱ类和Ⅲ类水质，而Ⅳ类水质的有6个，Ⅴ类水质的有5个。在9个国控重点大型淡水湖泊中，Ⅴ类和劣Ⅴ类水质各占了4个。

1.1.2.1　工业废水

随着城市化进程的加快，不少企业开始在乡镇农村建设工厂，使得乡镇企业得到了迅速的发展。但是，因为乡镇企业的效益比较差，能耗大，并且技术含量较低，尤其以造纸、纺织、染厂、化工厂、食品厂为主。这些工业废水的毒性和污染危害比较严重，并且在水中不易净化。导致一些对环境污染危害大的冶金、建材等企业在农村建设工厂，排入大量污水，造成严重污染。

1.1.2.2　生活污水污染

生活污水是人们日常生活中产生的各种污水混合物，污染成分复杂，产生量大，分布比较分散，不利于收集处理。目前我国农村自来水普及度低，基本没有生活污水处理系统，绝大部分的生活污水都直接排入村周围的河流、湖泊或水库，造成水体污染。由于农村公共设施匮乏，生活垃圾到处堆放，在经过长期的堆积后，会产生垃圾渗滤液，直接污染地下水。经过降雨的冲刷，生活垃圾中的大量污染物会进入地表水体，污染水体环境。

1.1.2.3　化肥农药过度使用(www.daowen.com)

化肥已经在农业生产中取代了以前的农家肥。根据调查，我国农业每年使用的化肥已经超过了4000万t，但是由于各种原因，导致其利用率仅有30%～40%。而另外我国农业生产中每年的使用量超过了120万t，其中仅有10%～20%附着在植物体上面，其余的都散落在土壤或水中，对地下水造成污染。这就是常说的农业面源污染，它会对水生态系统造成长期的危害，从而导致水环境退化。

1.1.2.4　畜禽业的污染

由于家禽及牲畜饲养大多采用散养（比如鸡、鸭、羊等），圈养的不多（猪等），所以村庄到处都散落着禽畜粪便。加之大部分厕所设计不合理，在遇到连续下雨时期，极易导致厕所粪便溢出，对水体造成十分严重的污染。为了追求经济利益，不少水产养殖大量采用化学肥料，导致水体富营养化。一些水产户还利用动物内脏来喂食鱼类，使得水体被动物内脏的细菌、病毒等污染。

1.1.2.5　污水灌溉造成的污染

目前，一些农村大量采用未经处理的污水直接灌溉农田，一些乡镇盲目开展污水灌溉的项目，对农村土壤、作物、地表水以及地下水都造成了严重的污染。污水灌溉主要集中在北方水资源比较匮乏的城市，比如海河、辽河、黄河、淮河4大流域。目前污水灌溉主要存在污水处理跟不上、污灌水质超标、污灌面积盲目扩大、污灌管理体系不健全、污灌研究滞后等问题。