企业集团财务共享中心建立后，其财务组织结构发生巨大的变化。组织管理不是简单的一张组织结构的图表，而是为核心业务建立有力的组织结构管理体系和制度保障。无论是与财务部门评级还是隶属于财务部门，它的组织架构是由独立、分散、分级的财务管理体系转向基于扁平化的管理理论——集战略财务、共享财务、业务财务于一体的管理制度体系，因此如何通过制度明确各机构的权责就显得格外重要。

组织架构各部门职能与职责不匹配，各岗位职责规范不明确，导致各部门之间相互推诿、权责划分不明确；上下级之间的权责范围不合理，从而引发了内部冲突。这些问题在问卷中都排在前边，都体现出财务共享中心组织架构设计缺陷的问题。而这种问题主要集中在建筑行业，建筑行业注重上下级之间的权限范围。但实践中正是因为其业务分布世界各地，各项目管理部不愿因为财务共享而失去其财务权利，这也正是组织架构设计的关键节点，如何合理分配划分机构职能及各部门管理办法及工作职责。(www.daowen.com)

不同行业的组织架构设计的重点不同，对于以“服务”为主的行业更注重各部门的管理办法及工作职责的规定，但实际推行中发现如何保持各部门管理办法的合理、平等及公平就显得格外重要，这是企业面临的问题。