环境合作是我国西南地区与东南亚国家跨国区域合作开发的一项重要内容，是在中国—东盟合作大框架下进行的。我国西南地区与东南亚国家跨国区域环境合作的顺利推进，在很大程度上将对中国—东盟自由贸易区建设能起促进作用。虽然它本身并不是中国—东盟自由贸易区的项目，但贸易、投资与环境是分不开的。随着中国—东盟自由贸易区建设的不断发展，相互投资将大大增加，建立跨境贸易、投资区势在必行，而环境问题及相应的合作是必须要考虑和进行的，环境合作是其他合作的重要前提条件。

中国—东盟的环境合作内容丰富，但从迫切性和可行性来看，我国西南地区与东南亚国家跨国区域的环境合作应是首选。首先，我国西南地区与东南亚国家跨国区域合作开发具有政策上的保证和支持，这是成功的基础和前提，具有可行性。其次，中国和东盟都认识到，开发和建设我国西南地区与东南亚国家跨国区域，不能再走发达国家“先污染，后治理”的老路，环境合作要先于其他合作项目开展起来，具有迫切性。(www.daowen.com)

我国西南地区与东南亚国家跨国区域合作，正在成为中国—东盟合作的热点，跨国区域的环境合作也将随之成为双方合作的一个新亮点。我国西南地区与东南亚国家跨国区域环境合作应当逐步纳入中国—东盟合作行动计划中去，形成具体的方案，并付诸实施。