薪资管理系统具有工资核算、工资发放、工资费用分摊、工资统计分析和个人所得税核算等功能。通常薪资管理系统功能主要包括以下三个方面：

（一）系统初始化设置

虽然各个单位的工资核算有很多共性，但也存在一些差异。通过工资系统初始化设置，可以根据企业需要建立工资账套数据，设置薪资管理系统运行所需要的各项基础信息，为日常处理建立应用环境。系统初始化包含薪资管理系统启用、工资账套参数设置和基础档案设置。

1.薪资管理系统启用

系统提供了两种方式启用薪资管理系统：一是在建账时同总账一起启用；二是在企业应用平台“基础设置”→“基础信息”菜单下的“系统启用”中进行启用。

2.工资账套参数设置

系统提供了工资类别核算、工资核算的币种、个人所得税、是否核算计件工资等账套参数设置。(www.daowen.com)

3.基础档案设置

系统提供发放次数管理、人员附加信息设置、工资项目设置、人员档案设置等功能。可以由企业自行设计工资项目及计算公式，并提供计件工资标准设置和计件工资方案选择。

（二）工资日常业务处理

薪资管理系统管理企业所有人员的工资数据，对人员增减、工资变动进行处理；自动计算个人所得税、结合工资发放形式进行扣零设置或向代发工资的银行传输工资数据；自动计算、汇总工资数据；支持计件工资核算模式；自动完成工资分摊和相关费用计提，并可以直接生成凭证传递到总账系统；提供对不同工资类别数据的汇总，从而实现统一工资核算的功能。

（三）期末处理

薪资管理系统可以进行月末结转和年末结转，还可以提供多层次、多角度的薪资报表管理。期末薪资管理系统将当期工资数据经过处理后结转至下期，并生成各种工资表和工资分析表，如工资发放签名表、部门工资汇总表、工资项目分析表等。齐全的工资报表形式、简便的资料查询方式满足了企业多层次、多角度查询的需要。