当亨利·杜邦成为家族和公司的领导者之后，美国政局发生了重大变化。1860年，共和党的亚伯拉罕·林肯成为了新任总统，美国南北双方之间根深蒂固的经济矛盾开始。虽然杜邦家族的传统是支持共和党，但作为特拉华州首屈一指的豪门，他们自然更加同情支持黑奴制度的南方，更不用说家族中的少数支系本身就是南卡罗来纳州的奴隶主。另一方面，亨利·杜邦的堂兄塞缪尔·杜邦却坚定反对奴隶制。以他为代表，部分杜邦人坚决支持林肯执政。

这是自从杜邦一家在美国登陆之后，第一次出现了家族内部的分歧。

1861年2月，在林肯的就职典礼之后，南方的叛乱开始了。杰弗逊·戴维斯宣誓就任南部同盟的总统。3月份，他下令招募了10万军队，由罗伯特·李将军指挥，准备迎接战争。

在南北政权激烈的对峙中，双方都各自派出使者来到特拉华州，希望能够拉拢杜邦家族，最起码，要能试探出他们的真正立场。然而，老谋深算的杜邦家人并不急于表态，直到1861年4月底，伴随着萨姆特要塞炮战开始，南北战争全面爆发后。查尔斯·杜邦才向弗吉尼亚州的南部同盟总统送出密函，保证家族中有部分人愿意支持南方。这封信内容重大，因此被迅速上呈到南部同盟军总司令罗伯特·李将军手中。

与此同时，阿尔弗莱德的次子拉蒙·杜邦，则收到来自华盛顿的信笺。这是国务卿威廉·斯瓦特和陆军总长西蒙·卡麦隆的紧急召见。按照信上的要求，拉蒙立刻赶到华盛顿。

拉蒙·杜邦，是此后30余年内协助亨利主持家族大局的中流砥柱。1849年，他毕业于宾夕法尼亚大学化学系，并同其最小的叔叔亚历克斯·杜邦（后因爆炸身亡），一起加入了火药厂工作。父亲阿尔弗莱德作为公司领导人的最后一年，拉蒙在不少研究项目中发挥了重要作用。为此，他经历了相当繁重工作的考验，尤其是在刚进入工厂时，按照父亲的要求，他在操作一线亲身体验了重复乏味的体力劳动，以至于短短四个月中瘦了14公斤。

在那段时间中，令人印象最为深刻的，是拉蒙对一次工厂范围之外事故的处理。

1854年5月31日清晨，有三辆四匹马拉的大篷车，各自装着2吨重的桶装杜邦火药，沿着市场街，向特拉华河码头缓缓走去。按照杜邦家的操作规程，每辆马车之间必须保持400米距离，万一发生爆炸事故，也能损失局限在一辆马车内。

鬼使神差的是，在这一天，杜邦企业的规章制度并没有被遵守。三辆马车几乎挤到了一起，当其中一辆马车突然爆炸时，马上引爆了另外两辆。总共有三匹马、三位车夫和两个路过市民在爆炸中丧生，市场街两旁的建筑也收到了很大破坏。(www.daowen.com)

由于这一惨烈事件，杜邦公司费尽心力和威尔明顿城建立起来的融洽关系，受到了巨大损害。亚历克斯·杜邦是家族中第一个赶到现场的人，他碰到一群愤怒的民众，嚷着要吊死杜邦家族中的每个人。幸运的是，拉蒙随后赶到了事发地点，身边还带着工人们，他们一起维持住局面，震慑住那些愤怒得几乎要失去理智的人们，让他们最终放弃了用私刑来解决问题的冲动。

此后，杜邦公司花了将近10万美元来赔偿爆炸引起的损伤。由于爆炸而损失的声誉，却只能依靠时间来恢复。为了让市民的愤怒得以平息，并确保日后的安全，杜邦公司修筑了一条环城马路，以便能够安全地将危险的火药产品，运输到克里斯蒂娜河边。在那里，有着新建的独立码头，可以将火药运送到船上。直到今天，这条马路依然被称为杜邦路。

当阿尔弗莱德去世之后，拉蒙继承了他对技术的兴趣，继续努力提炼硝酸钠。1857年，他发明了一种新方法，能够让这种原料更为适合于生产火药，并由此获得了专利。在新配方中，含有了较高比例的氧和氮，可以将导致火药潮湿的硝酸盐杂质燃烧殆尽，在火药生产的技术方面，这是相当重要的进步，不仅降低了生产成本，还减少了对英国企业生产的硝酸钾的依赖。

1858年，在亨利·杜邦的决策下，拉蒙出国进修。这既是对他之前投入企业技术发明工作的奖励，同时也赋予这位家族中后起之秀考察英国和欧洲大陆火药生产技术的重任。

在乘坐“阿拉伯”号客船前往欧洲的航程中，拉蒙同船长成了好朋友，并经常与之分享上等雪茄。一天，在闲聊中，拉蒙自豪地告诉了船长自己的身份，还不无得意地透露说，自己的房间里有四磅火药，是带到欧洲去换取样品的。船长的表情顿时僵住了，他盯着拉蒙嘴角旁雪茄闪烁的红光，马上叫来手下，让他们将火药拿到轮船的储藏室中。

三个月后，拉蒙不辱使命，回到美国。他带回了一大堆的图纸、专利副本和实验室设备，同时也带来了参观比利时、德国、法国、英国和爱尔兰火药厂的经验。无论是装在手提箱内的文件，还是他脑海中宛如火山熔岩般奔腾的想法，都充满了各种各样的创新因素，而其中很大一部分，并不被较为保守的叔叔亨利所接受。

幸运的是，此时决定杜邦公司命运的，并不是技术本身，而是国内局势的发展。1861年，随着南北关系的日益紧张，拉蒙在华盛顿接受了北方政府的指令，他将很快再次踏上伦敦的土地。