至明代中叶，又出现了冯嘉施兰、吕宋、合猫里、猫里务、网巾礁老、古麻剌朗、沙瑶等新的古国并立，其中以北部的吕宋和南部的苏禄最为强盛。苏禄从元朝时期一直存在至19世纪中叶，是菲律宾历史上存在最长的古国。1379年（明朝初期），有华人到菲律宾传授酿酒法；1644年明朝灭亡，华人移居菲律宾达到高潮。郑和七下西洋（1405—1433年），通过海舶技术的革新推动了海上贸易，让更多的中国人踏上了下南洋的征程，其中就包括前往菲律宾群岛谋生。郑和或其随行人员曾3次对菲律宾的仁牙因、马尼拉、民都洛和苏禄群岛进行访问，促进了中菲国家关系、贸易关系迅速发展。这有利于创造良好的环境，使中国人乐意前往菲律宾从事贸易，甚至长期定居，与当地人通婚。“明朝隆庆年间（1567—1572年）吕宋（今菲律宾）开洋，募华人为市。初，无以应者。镇商李寓西、陈斗岩首航吕宋与贸，获巨利归。安平(福建安海旧称)人乃多从而趋之，几至十家而九。去者或久客不归，间有籍居生长子女者。”^[3]随着中菲通商贸易的兴隆，因业务需要或为躲避台风滞留在菲律宾的中国商人日益增多，也有人是专门下南洋经商的。他们散居在菲岛各处，在当地娶妻生子后定居下来。

活跃于广东、福建和台湾沿海的中国海盗林凤，被官兵追剿而漂洋逃遁。1574年，林凤率领战船62艘、士兵2000人、妇孺1500人，还有众多的各业工匠向菲律宾进发，作久居之计。抵马尼拉后与西班牙殖民当局的守军交战，驻菲军队总指挥戈第被林凤部所杀。西班牙总督拉维萨里斯立即组织力量进行反扑，最后林凤败退至邦阿西楠建立居留地。1575 年，林凤被围四个月后，沿河出海回国。但所乘30艘船都是小船，无法载走所有随行人员。可以想象，林凤带走的应多是作战士兵，留下的当多是妇幼和工匠。这些人为了求生，避开殖民者而进入吕宋北部山区，与当地的伊戈洛特族人杂居、通婚，向他们传授中国的耕作技术和手工艺。最早明确记载华人在菲律宾居留情况的是西班牙殖民者。据史料汇编《菲律宾群岛》（The Philippine Islands，1493—1898年）所载，1570年5月驻菲军队总指挥戈第抵达马尼拉时，发现那里住着40名已婚的中国人和20名日本人；而当黎牙实比1571年再次进攻马尼拉时，发现居住在那里的华人有150名^[4]。据Alip估计，至1565年黎牙实比登陆菲岛的时候，那里的中国人很可能不少于1000人^[5]。到17世纪初，定居菲律宾的华人超过1万人。(www.daowen.com)

16—18世纪的“重商主义”盛行时期，中菲之间的“大帆船贸易”，使得华商来菲律宾的西班牙殖民地从事贸易者的人数日渐增多。有些华侨商人久住不归，聚居在涧内（Parian，市场之意）生活，人数逐渐增至几万人。1582 年，西班牙殖民当局为便于对华侨的防范、管理、控制、征税和敲诈勒索，在马尼拉城北与巴石河之间的荒地围以栅栏，令华侨在其中居住，称此地为Parian（翻译成“帕里安”或“八连”），它处在圣加夫列尔堡的枪炮射程之内。在西班牙人踏上菲律宾宿务岛时就发现有中国人，即把华人称作Sangley，闽南语为“商旅”或“生意人”。菲人称中国人为生意人，足见其经济动因。此外，在宿务等地也曾设有“八连”。西班牙殖民者对华、菲两族人民分而治之加上挑拨离间的手法，是造成华菲隔阂与矛盾长期存在的重要原因。